RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516264.1

RNU6-947P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 947, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-947P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-947P-201ENST00000516264 SPEF2Q9C093 1822 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 RPRMQ9NS64 109 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 V9GYV3 84 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 SBF2Q86WG5 1849 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 GOLGA3Q08378 1498 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 NAIPQ13075 1403 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 A0A0D9SFI3 127 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 C10orf142B7Z368 130 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 MT-ND4LP03901 98 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 SPINK8P0C7L1 97 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 PIRTP0C851 137 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 CBLN1P23435 193 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 UBE2D1P51668 147 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 CLLU1Q5K131 121 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 IFI27L1Q96BM0 104 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 COPZ2Q9P299 210 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 NDUFA12Q9UI09 145 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 U3KQA8 63 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 F8P00451 2351 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 PLXNB2O15031 1838 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 MYOM1P52179 1685 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 QRICH2Q9H0J4 1663 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 ABCA2Q9BZC7 2435 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 COL7A1Q02388 2944 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 CHD9Q3L8U1 2897 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 TCHHQ07283 1943 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 FAM92AA1XBS5 289 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 NMBP08949 121 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 IGLC6P0CF74 106 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 SMIM6P0DI80 62 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 NPC2P61916 151 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 BTG2P78543 158 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 IQCJQ1A5X6 159 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 Q6ZUT4 128 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 C20orf197Q8N268 126 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 C1orf54Q8WWF1 131 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 LZICQ8WZA0 190 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 Q96NJ1 140 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 PFDN5Q99471 154 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 WFDC6Q9BQY6 131 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 PTPN13Q12923 2485 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 DOCK11Q5JSL3 2073 aa-0.02□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 A6NIN4 97 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 M0R2Z0 102 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 NPFFO15130 113 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 NDUFB6O95139 128 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 ACYP2P14621 99 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 GCHFRP30047 84 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 EDDM3BP56851 147 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 CKS1BP61024 79 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 SMCO1Q147U7 214 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 SMIM21Q3B7S5 101 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 Q5VSD8 79 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 Q6ZRX8 168 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 BAGE3Q86Y29 109 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 MAFIPQ8WZ33 124 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 AMELXQ99217 191 aa-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-0.03□□□□□ -2.41
RNU6-947P-201ENST00000516264 ANK2Q01484 3957 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 FLNCQ14315 2725 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 AHCTF1Q8WYP5 2266 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 SIX6O95475 246 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 CCL18P55774 89 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 RPS25P62851 125 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 S100A12P80511 92 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 COX17Q14061 63 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 SMIM4Q8WVI0 70 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 SPTSSAQ969W0 71 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 SNRNP25Q9BV90 132 aaKnown RBP-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 LENEPQ9Y5L5 61 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 SYNJ1O43426 1573 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 BICRAQ9NZM4 1560 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 SPTBN2O15020 2390 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 MRC2Q9UBG0 1479 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 NALCNQ8IZF0 1738 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa-0.04□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 MYH7P12883 1935 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 PI4KAP42356 2102 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 CLPSL1A2RUU4 121 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 G3V318 75 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 ARPC5O15511 151 aa-0.05□□□□□ -2.42
RNU6-947P-201ENST00000516264 PITX3O75364 302 aa-0.05□□□□□ -2.42
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.1 ms