RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511586.5

PDLIM5-215, Transcript of PDZ and LIM domain 5, human

TSL 4

Gene PDLIM5, Length 547 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PDLIM5-215	ENST00000511586	OR5AL1	P0C617	328 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	GYPE	P15421	78 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	S100A2	P29034	98 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	SRI	P30626	198 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	CAMP	P49913	170 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	TMEM136	Q6ZRR5	245 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	SH2D6	Q7Z4S9	175 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	GTSF1	Q8WW33	167 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	SSBP4	Q9BWG4	385 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	JPT2	Q9H910	190 aa		4.95	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586		A0A1B0GXF2	115 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586		M0R2N4	97 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	PHOX2A	O14813	284 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	SNAI2	O43623	268 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	CTRL	P40313	264 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	RHOH	Q15669	191 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	SPANXN1	Q5VSR9	72 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	UFSP1	Q6NVU6	142 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	OR10AG1	Q8NH19	301 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	UPK3B	Q9BT76	320 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	SAMD10	Q9BYL1	202 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586		Q9H8V8	135 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	HYDIN	Q4G0P3	5121 aa		4.94	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586		A0A087WWL8	130 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	MUC21	A0A0G2JKD1	596 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	LOC100131303	A0A0U1RQF7	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	MUC21	A0A140T8X8	626 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586		F2Z2F3	143 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	NXPH4	O95158	308 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	CRYGD	P07320	174 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	SST	P61278	116 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	PDZD11	Q5EBL8	140 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	LYZL1	Q6UWQ5	148 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586		Q6ZSN1	163 aa		4.93	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	IGLC6	P0CF74	106 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	FOXA3	P55318	350 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	CACNG7	P62955	275 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	KIAA1644	Q3SXP7	199 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586		Q6ZR54	194 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	BAGE3	Q86Y29	109 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	HIST3H2BB	Q8N257	126 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	C14orf178	Q8N769	122 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	KMT2A	Q03164	3969 aa		4.92	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	NBDY	A0A0U1RRE5	68 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	GAGE12J	A6NER3	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	SIVA1	O15304	175 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	SMIM17	P0DL12	118 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	FABP4	P15090	132 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	TIRAP	P58753	221 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	GAGE1	Q13065	139 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	GAGE4	Q13068	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	GAGE5	Q13069	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	TWIST1	Q15672	202 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	GAGE13	Q4V321	117 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	TTC32	Q5I0X7	151 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	OR10J3	Q5JRS4	329 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	SMIM15	Q7Z3B0	74 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	AP1S3	Q96PC3	154 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	NACA	E9PAV3	2078 aa		4.91	□□□□□ -1.62
PDLIM5-215	ENST00000511586	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586		F5H697	171 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	SERF1A	O75920	110 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	NTF3	P20783	257 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	ZNF56	Q15929	161 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	C1orf134	Q5TEV5	83 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	LINC00336	Q6ZUF6	198 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	GATD1	Q8NB37	220 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	TMEM18	Q96B42	140 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	PACRG	Q96M98	296 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	MSRB1	Q9NZV6	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586		Q9UF83	564 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	KIF25-AS1	Q9Y6Z4	181 aa		4.9	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	TRAV9-2	A0A087WT02	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	TRAV8-6	A0A0B4J262	113 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	SMIM6	P0DI80	62 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	LINC00694	P0DN24	101 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	LINC00315	P59091	139 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	RPL36A	P83881	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586		Q0VG73	95 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	LELP1	Q5T871	98 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	RNASEK	Q6P5S7	137 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	C6orf223	Q8N319	242 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	C18orf32	Q8TCD1	76 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	ALKBH7	Q9BT30	221 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	CNFN	Q9BYD5	112 aa		4.89	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PDLIM5-215	ENST00000511586	IFITM10	A6NMD0	228 aa		4.88	□□□□□ -1.63

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