RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495428.5

CMC1-211, Transcript of C-X9-C motif containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene CMC1, Length 608 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMC1-211ENST00000495428 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 TTC37Q6PGP7 1564 aa-0.36□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 MYO3AQ8NEV4 1616 aa-0.37□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 MON2Q7Z3U7 1717 aa-0.37□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 TRAV5A0A0B4J249 113 aa-0.37□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 LYRM1O43325 122 aa-0.37□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 IGHV3-30P01768 117 aa-0.37□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa-0.37□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 MT1GP13640 62 aa-0.37□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 SNCBQ16143 134 aa-0.37□□□□□ -2.47
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CMC1-211ENST00000495428 DPH3P1Q9H4G8 78 aa-0.37□□□□□ -2.47
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CMC1-211ENST00000495428 ARHGEF10O15013 1369 aa-0.37□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 ATP7BP35670 1465 aa-0.37□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-0.37□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 CD109Q6YHK3 1445 aa-0.38□□□□□ -2.47
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CMC1-211ENST00000495428 G3V2T6 193 aa-0.38□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 SULT1C4O75897 302 aa-0.38□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 IFNA6P05013 189 aa-0.38□□□□□ -2.47
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CMC1-211ENST00000495428 ZNF56Q15929 161 aa-0.38□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 PHB2Q99623 299 aa-0.38□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 TAF9BQ9HBM6 251 aa-0.38□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-0.38□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 RICTORQ6R327 1708 aa-0.38□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 UNC13AQ9UPW8 1703 aa-0.38□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 SCRIBQ14160 1630 aa-0.38□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa-0.38□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 ATP10BO94823 1461 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 NCAPD3P42695 1498 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 RIIAD1A6NNX1 92 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 C10orf142B7Z368 130 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 H7C1C5 153 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 AIPO00170 330 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 CST7O76096 145 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 LCN6P62502 163 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 SCGB2B2Q4G0G5 96 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 C1orf140Q5VVS0 124 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 PLEKHB2Q96CS7 222 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 SS18L2Q9UHA2 77 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 MYO5CQ9NQX4 1742 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 IFT172Q9UG01 1749 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 AGLP35573 1532 aa-0.39□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 PLXNA2O75051 1894 aa-0.39□□□□□ -2.47
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CMC1-211ENST00000495428 PHBP35232 272 aa-0.4□□□□□ -2.47
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CMC1-211ENST00000495428 CSAG1Q6PB30 78 aa-0.4□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 SMIM5Q71RC9 77 aa-0.4□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 C5orf17Q8NAS9 161 aa-0.4□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 CARD19Q96LW7 228 aa-0.4□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 PROK2Q9HC23 129 aa-0.4□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa-0.4□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 USP54Q70EL1 1684 aa-0.4□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 DSPPQ9NZW4 1301 aa-0.4□□□□□ -2.47
CMC1-211ENST00000495428 PZPP20742 1482 aa-0.41□□□□□ -2.47
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CMC1-211ENST00000495428 LOC730098B7Z3J9 87 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 MT1EP04732 61 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 EVI2AP22794 236 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 RPS3P23396 243 aaKnown RBP eCLIP-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 HSD11B1P28845 292 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 CAPZBP47756 277 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 DEFA5Q01523 94 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 FADDQ13158 208 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 FXYD3Q14802 87 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 GRPEL2Q8TAA5 225 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 OR4C12Q96R67 309 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 EFCAB11Q9BUY7 163 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 SSR3Q9UNL2 185 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 TPRKBQ9Y3C4 175 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 ALS2Q96Q42 1657 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 FHAD1B1AJZ9 1412 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 CLIP1P30622 1438 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 MROH2BQ7Z745 1585 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 TANC2Q9HCD6 1990 aa-0.41□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 RTL9Q8NET4 1388 aa-0.42□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 ATG12O94817 140 aa-0.42□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 MT-ND6P03923 174 aa-0.42□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 MT1AP04731 61 aa-0.42□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 CSN2P05814 226 aa-0.42□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 RPL35P42766 123 aaKnown RBP-0.42□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 AKR1C8PQ5T2L2 129 aa-0.42□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 Q5VV11 94 aa-0.42□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 FKBP1CQ5VVH2 108 aa-0.42□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-0.42□□□□□ -2.48
CMC1-211ENST00000495428 CCL4L1Q8NHW4 92 aa-0.42□□□□□ -2.48
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