RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 SPATA12Q7Z6I5 190 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 SMIM7Q9BQ49 75 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 DNAH5Q8TE73 4624 aa12.79□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 ZNF727A8MUV8 499 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 KRTAP10-2P60368 255 aa12.78□□□□□ -0.36
NISCH-209ENST00000485765 LAGE3Q14657 143 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 Q8N3U1 123 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 GTSF1Q8WW33 167 aa12.77□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 C16orf90A8MZG2 172 aa12.76□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 M0QY20 66 aa12.76□□□□□ -0.37
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NISCH-209ENST00000485765 TRGC1P0CF51 173 aa12.76□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP12.76□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 LINC01551Q86U37 167 aa12.76□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 NIT1Q86X76 327 aa12.76□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 A0A087WTM6 91 aa12.75□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 F8W036 122 aa12.75□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 ERVFC1-1P60608 527 aa12.75□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 CT83Q5H943 113 aa12.75□□□□□ -0.37
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NISCH-209ENST00000485765 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 DNAJC30Q96LL9 226 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 DPH3P1Q9H4G8 78 aa12.74□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP12.74□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa12.74□□□□□ -0.37
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NISCH-209ENST00000485765 MGPP08493 103 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 TWIST1Q15672 202 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 TMEM241Q24JQ0 296 aa12.73□□□□□ -0.37
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NISCH-209ENST00000485765 NAT8Q9UHE5 227 aa12.73□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 LRCOL1A6NCL2 159 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 H7C1H1 209 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 OSTCQ9NRP0 149 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 RYR1P21817 5038 aa12.72□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 TMEM97Q5BJF2 176 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP12.71□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 SEC11CQ9BY50 192 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 Q9HAA7 133 aa12.71□□□□□ -0.37
NISCH-209ENST00000485765 HSPG2P98160 4391 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP12.7□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 RASL11AQ6T310 242 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 GFRA4Q9GZZ7 299 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa12.7□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 FAM231BA6NCW3 169 aa12.69□□□□□ -0.38
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NISCH-209ENST00000485765 TM2D2Q9BX73 214 aa12.69□□□□□ -0.38
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NISCH-209ENST00000485765 FRZBQ92765 325 aa12.68□□□□□ -0.38
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NISCH-209ENST00000485765 RPL23P62829 140 aaKnown RBP12.67□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 ELOBQ15370 118 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 GATD1Q8NB37 220 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 ISOC2Q96AB3 205 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 KLK12Q9UKR0 248 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 V9GYV3 84 aa12.67□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 TMEM262E9PQX1 116 aa12.66□□□□□ -0.38
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NISCH-209ENST00000485765 C15orf54Q8N8G6 183 aa12.66□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 HIGD1CA8MV81 97 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 PKIAP61925 76 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 KCNIP4Q6PIL6 250 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 SMIM15Q7Z3B0 74 aa12.65□□□□□ -0.38
NISCH-209ENST00000485765 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP12.64□□□□□ -0.39
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NISCH-209ENST00000485765 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa12.64□□□□□ -0.39
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NISCH-209ENST00000485765 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
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NISCH-209ENST00000485765 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa12.63□□□□□ -0.39
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NISCH-209ENST00000485765 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 A0A1B0GUT8 65 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 APOC3P02656 99 aa12.63□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 PPP1R2P9O14990 202 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 SNAPINO95295 136 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 MT-ND4LP03901 98 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 Q0VG73 95 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 ENHOQ6UWT2 76 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 UBE2WQ96B02 151 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 BORCS7Q96B45 105 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 RMI2Q96E14 147 aa12.62□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 ADCYAP1P18509 176 aa12.61□□□□□ -0.39
NISCH-209ENST00000485765 C10orf91Q5T1B1 145 aa12.61□□□□□ -0.39
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