RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468641.1

PTPRZ1-203, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type Z1, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRZ1, Length 554 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRZ1-203ENST00000468641 PP6455Q8WZ26 134 aa0.71□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 FAM103A1Q9BTL3 118 aaKnown RBP0.71□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 C10orf95Q9H7T3 257 aa0.71□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 CUL7Q14999 1698 aa0.71□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 DAPK1P53355 1430 aa0.71□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 A2ML1A8K2U0 1454 aa0.7□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 IFT140Q96RY7 1462 aa0.7□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 SPINK13Q1W4C9 94 aa0.7□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa0.7□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 ARAP2Q8WZ64 1704 aa0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 C4orf33Q8N1A6 199 aa0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 MYH8P13535 1937 aa0.69□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 DOCK11Q5JSL3 2073 aa0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 HCG22E2RYF7 251 aa0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 CCL8P80075 99 aa0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 DSCR8Q96T75 97 aa0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 NAA60Q9H7X0 242 aa0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 COA4Q9NYJ1 87 aa0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 NWD2Q9ULI1 1742 aa0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 LINC00312Q9Y6C7 94 aa0.68□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 OOSP1A8MZH6 123 aa0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 AKAIN1P0CW23 69 aa0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 EDDM3BP56851 147 aa0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 Q56UQ5 140 aa0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 RPL7L1Q6DKI1 246 aaKnown RBP0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZNF818PQ6ZRF7 136 aa0.67□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 RBAKDNA6NC62 111 aa0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 SIX6O95475 246 aa0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 PRDM2Q13029 1718 aa0.66□□□□□ -2.3
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa0.65□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 SHROOM2Q13796 1616 aa0.65□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa0.65□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa0.65□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 A6NIN4 97 aa0.65□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 CORTO00230 105 aa0.65□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 IFNA17P01571 189 aa0.65□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.65□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 WFDC6Q9BQY6 131 aa0.65□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.65□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.65□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 F6UZH7 168 aa0.64□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 CATR1Q13166 79 aa0.64□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 COPS9Q8WXC6 57 aa0.64□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 LINC00474Q9P2X8 69 aa0.64□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 V9GYV3 84 aa0.64□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 DOCK2Q92608 1830 aa0.64□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 MYOM2P54296 1465 aa0.63□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa0.63□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 TNFP01375 233 aa0.63□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 IFNGP01579 166 aa0.63□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 GOLGA3Q08378 1498 aa0.62□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa0.62□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 FAM74A4Q5TZK3 123 aa0.62□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 C12orf73Q69YU5 71 aa0.62□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa0.62□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 SPANXDQ9BXN6 97 aa0.62□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 CPSF1Q10570 1443 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 NAIPQ13075 1403 aa0.62□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP0.62□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 PSME4Q14997 1843 aa0.61□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 WDR7Q9Y4E6 1490 aa0.61□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 IFT172Q9UG01 1749 aa0.61□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 KDM6BO15054 1643 aa0.61□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 LRRC37A3O60309 1634 aa0.61□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 JMJD1CQ15652 2540 aa0.61□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 APOC2P02655 101 aa0.61□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa0.61□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 TSLPQ969D9 159 aa0.61□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 ZNF236Q9UL36 1845 aa0.61□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 G3V318 75 aa0.6□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 SNAPC5O75971 98 aa0.6□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 FXYD6P3P58550 94 aa0.6□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP0.6□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 C5orf38Q86SI9 138 aa0.6□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 TMEM203Q969S6 136 aa0.6□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 GNG8Q9UK08 70 aa0.6□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa0.6□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 PZPP20742 1482 aa0.6□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 PXDNQ92626 1479 aa0.6□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP0.59□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 ACYP2P14621 99 aa0.59□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 CCL18P55774 89 aa0.59□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 TPPP2P59282 170 aa0.59□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 C9orf153Q5TBE3 101 aa0.59□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 VMO1Q7Z5L0 202 aa0.59□□□□□ -2.31
PTPRZ1-203ENST00000468641 MYO7AQ13402 2215 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRZ1-203ENST00000468641 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP0.58□□□□□ -2.32
PTPRZ1-203ENST00000468641 APCP25054 2843 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRZ1-203ENST00000468641 PI4KAP42356 2102 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRZ1-203ENST00000468641 PHGR1C9JFL3 82 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRZ1-203ENST00000468641 PRH1P02810 166 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRZ1-203ENST00000468641 S100A1P23297 94 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRZ1-203ENST00000468641 GNG4P50150 75 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRZ1-203ENST00000468641 C10orf128Q5T292 105 aa0.58□□□□□ -2.32
PTPRZ1-203ENST00000468641 Q6ZRX8 168 aa0.58□□□□□ -2.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.5 ms