RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468018.5

ATG4B-215, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4B, Length 721 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-215ENST00000468018 NTF3P20783 257 aa10.12□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 SSTP61278 116 aa10.12□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 CDPF1Q6NVV7 123 aa10.12□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 GTSF1Q8WW33 167 aa10.12□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.12□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa10.11□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 F5H697 171 aa10.11□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 TRGC1P0CF51 173 aa10.11□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 CT83Q5H943 113 aa10.11□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 SUMO4Q6EEV6 95 aa10.11□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 TEX261Q6UWH6 196 aa10.11□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 LINC01551Q86U37 167 aa10.11□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 EREGO14944 169 aa10.1□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa10.1□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 DNAJC30Q96LL9 226 aa10.1□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 DPH3P1Q9H4G8 78 aa10.1□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.09□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 SMIM7Q9BQ49 75 aa10.09□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa10.09□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 Q9HAA7 133 aa10.09□□□□□ -0.79
ATG4B-215ENST00000468018 H7C1H1 209 aa10.08□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 GATCO43716 136 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 MGPP08493 103 aa10.08□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 DNAH8Q96JB1 4490 aa10.07□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 ZNF727A8MUV8 499 aa10.07□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 A8MWL6 223 aa10.07□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 C9JQL5 133 aa10.07□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP10.07□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 CEBPGP53567 150 aa10.07□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 TMEM97Q5BJF2 176 aa10.07□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 ATRAIDQ6UW56 229 aa10.07□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa10.07□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 OSTCQ9NRP0 149 aa10.07□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 PSCAO43653 123 aa10.06□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 TWIST1Q15672 202 aa10.06□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 RASL11AQ6T310 242 aa10.06□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 TM2D2Q9BX73 214 aa10.06□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa10.06□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 WFDC2Q14508 124 aa10.05□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 IQCJQ1A5X6 159 aa10.05□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 MPV17L2Q567V2 206 aa10.05□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 Q8N814 137 aa10.05□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 FRZBQ92765 325 aa10.05□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 GFRA4Q9GZZ7 299 aa10.05□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 SMDT1Q9H4I9 107 aa10.05□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 NIT2Q9NQR4 276 aa10.05□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 KLK12Q9UKR0 248 aa10.05□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 A0A087WX48 190 aa10.04□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 FAM231BA6NCW3 169 aa10.04□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP10.04□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 ELOBQ15370 118 aa10.04□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 FAM74A3Q4VXF1 159 aa10.04□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP10.04□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 TSKUQ8WUA8 353 aa10.04□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 ISOC2Q96AB3 205 aa10.04□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 PGLYRP4Q96LB8 373 aa10.04□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 COX11Q9Y6N1 276 aa10.04□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa10.03□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 KRTAP10-1P60331 282 aa10.03□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 PKIAP61925 76 aa10.03□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 RPL23P62829 140 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 GATD1Q8NB37 220 aa10.03□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 V9GYV3 84 aa10.03□□□□□ -0.8
ATG4B-215ENST00000468018 HIGD1CA8MV81 97 aa10.02□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 Q0VG73 95 aa10.02□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 TMEM241Q24JQ0 296 aa10.02□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 ENHOQ6UWT2 76 aa10.02□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 UBE2WQ96B02 151 aa10.02□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 RMI2Q96E14 147 aa10.02□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa10.02□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 FAT1Q14517 4588 aa10.02□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 TMEM262E9PQX1 116 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 PEA15Q15121 130 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 KCNIP4Q6PIL6 250 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 Q8N976 141 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 CHCHD5Q9BSY4 110 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 PRR34Q9NV39 138 aa10.01□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 XGP55808 180 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 RBX1P62877 108 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 NAT8Q9UHE5 227 aa10□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 A0A1B0GUT8 65 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 GCSHP23434 173 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 C15orf54Q8N8G6 183 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 TMEM191AQ9H0A3 160 aa9.99□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 A0A1B0GUV1 79 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 ANGP03950 147 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 GAGE6Q13070 117 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 MIAQ16674 131 aa9.98□□□□□ -0.81
ATG4B-215ENST00000468018 SMIM15Q7Z3B0 74 aa9.98□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms