RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 IGKV1-17P01599 117 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 GP9P14770 177 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 ZNF493Q6ZR52 646 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 GPHB5Q86YW7 130 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 JPT2Q9H910 190 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa5.91□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa5.9□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa5.9□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 HOXD3P31249 432 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 MORN5Q5VZ52 161 aa5.9□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 FANCD2OSQ96PS1 177 aa5.9□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 CTRLP40313 264 aa5.9□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 LINC00643Q86TS7 51 aa5.9□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 ZNF491Q8N8L2 437 aa5.9□□□□□ -1.46
USP54-210ENST00000466048 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 FXYD2P54710 66 aa5.9□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 MRAPQ8TCY5 172 aa5.9□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 PRR25Q96S07 402 aa5.9□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 NDUFA12Q9UI09 145 aa5.9□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 FREM2Q5SZK8 3169 aa5.9□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa5.9□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa5.9□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 BRI3O95415 125 aa5.9□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 BLCAPP62952 87 aa5.9□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 TMEM243Q9BU79 118 aa5.9□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 CFAP54Q96N23 3096 aa5.9□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 IGKV3OR2-268A0A0C4DH90 116 aa5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 C2orf70A6NJV1 201 aa5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 RHODO00212 210 aa5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 MALP21145 153 aa5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 NDPQ00604 133 aa5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 TNCP24821 2201 aa5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 DEFB131AP59861 70 aa5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 ASPHD1Q5U4P2 390 aa5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 RNF152Q8N8N0 203 aa5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 GTSF1Q8WW33 167 aa5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 SPATA25Q9BR10 227 aa5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 ZNF580Q9UK33 172 aa5.89□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 E9PLD3 99 aa5.88□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 RHOHQ15669 191 aa5.88□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 A0A1B0GX51 115 aa5.88□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 Q8TAT8 98 aa5.88□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 TLN2Q9Y4G6 2542 aa5.88□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 H3BQ85 93 aa5.88□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 hADV29S1A0JD25 119 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 IMUPQ9GZP8 106 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 LENEPQ9Y5L5 61 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 A0A0U1RRA0 63 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 H0YGX0 51 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 I3L3M4 83 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 ERCC8Q13216 396 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 TM2D2Q9BX73 214 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 Q6ZSV7 163 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 MGAQ8IWI9 3026 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 CTSGP08311 255 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 BAALC-AS2P0C853 105 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 DEFB136Q30KP8 78 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 PRR31Q5SQ13 230 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa5.87□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 LGALS9O00182 355 aa5.86□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 SMR3AQ99954 134 aa5.86□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa5.86□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 ABCA12Q86UK0 2595 aa5.86□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 MYO9AB2RTY4 2548 aa5.86□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 SDHAF1A6NFY7 115 aa5.86□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 PTH2Q96A98 100 aa5.85□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 RBAKDNA6NC62 111 aa5.85□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 HAMPP81172 84 aa5.85□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 C6orf226Q5I0X4 101 aa5.85□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 Q6Q795 121 aa5.85□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 LINC00173Q6ZV60 143 aa5.85□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 V9GYY9 64 aa5.85□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa5.84□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 F6UB75 175 aa5.84□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 IGLV2-8P01709 118 aa5.84□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 HERVK_113P63121 156 aa5.84□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 C16orf95Q9H693 158 aa5.84□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 C3orf22Q8N5N4 141 aa5.84□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 DSCR8Q96T75 97 aa5.84□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 ICOSQ9Y6W8 199 aa5.84□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 MT-ATP8P03928 68 aa5.84□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 C8orf49Q96NF6 230 aa5.84□□□□□ -1.47
USP54-210ENST00000466048 A4D1N5 150 aa5.84□□□□□ -1.48
USP54-210ENST00000466048 OXLD1Q5BKU9 147 aa5.84□□□□□ -1.48
USP54-210ENST00000466048 DPH3Q96FX2 82 aa5.84□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms