RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428892.1

APOBEC3C-202, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

TSL 3

Gene APOBEC3C, Length 1,056 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-202ENST00000428892 F2Z2F3 143 aa7.53□□□□□ -1.2
APOBEC3C-202ENST00000428892 APCSP02743 223 aa7.53□□□□□ -1.2
APOBEC3C-202ENST00000428892 TTC32Q5I0X7 151 aa7.53□□□□□ -1.2
APOBEC3C-202ENST00000428892 GTSF1Q8WW33 167 aa7.53□□□□□ -1.2
APOBEC3C-202ENST00000428892 TPPP3Q9BW30 176 aa7.53□□□□□ -1.2
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRGV11A0A075B6L2 103 aa7.52□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa7.52□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7.52□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 C5orf52A6NGY3 159 aa7.52□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 GZMBP10144 247 aa7.52□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF415Q09FC8 603 aa7.52□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM159AQ6UWV7 190 aa7.52□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.52□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.52□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 APOBP04114 4563 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 GNRH2O43555 120 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 S100A2P29034 98 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 RASL10AQ92737 203 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.51□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A1B0GXF2 115 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 H3BNG1 76 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 PHOX2AO14813 284 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 KCNS1Q96KK3 526 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPXQ9BT56 116 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q9H8V8 135 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 NAGKQ9UJ70 344 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNAH5Q8TE73 4624 aa7.5□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRGV2A0A075B6R0 118 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 GRIFINA4D1Z8 144 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 INAFM2P0DMQ5 153 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 MALP21145 153 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 S100A4P26447 101 aaKnown RBP7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 AKR1D1P51857 326 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 CACNG7P62955 275 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 TWIST1Q15672 202 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 BAGE3Q86Y29 109 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 VSIG2Q96IQ7 327 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 PLA2G2DQ9UNK4 145 aa7.49□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 ARMS2P0C7Q2 107 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGLC6P0CF74 106 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 CTRLP40313 264 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 ASIPP42127 132 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 FHL2Q14192 279 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 HERC1Q15751 4861 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 C9orf85Q96MD7 179 aa7.48□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 M0R2P5 195 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP10-2P60368 255 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q0VG73 95 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 KIAA1644Q3SXP7 199 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 GATD1Q8NB37 220 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 PTH2Q96A98 100 aa7.47□□□□□ -1.21
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A0J9YY99 117 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 IGHV3-53P01767 116 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 OR5AL1P0C617 328 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 NTF3P20783 257 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 SRIP30626 198 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 SSTP61278 116 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 SLAQ13239 276 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 DNLZQ5SXM8 178 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF479Q96JC4 524 aa7.46□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 A0A096LPF7 62 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 TRAV4A0A0B4J268 109 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 CRYBA4P53673 196 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 HIST3H2BBQ8N257 126 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM18Q96B42 140 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 CNFNQ9BYD5 112 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 PRO0255Q9UI72 69 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa7.45□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 MUC21A0A140T8X8 626 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 H3BVH4 76 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 SNAI2O43623 268 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 PDZD11Q5EBL8 140 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 Q5VSD8 79 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 ALKBH7Q9BT30 221 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 TMEM191AQ9H0A3 160 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.44□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 RS1O15537 224 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 ESRGQ1W209 222 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 ZNF876PQ49A33 203 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 UPK3BQ9BT76 320 aa7.43□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 PAX4O43316 350 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 PPBPP02775 128 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 FABP4P15090 132 aa7.42□□□□□ -1.22
APOBEC3C-202ENST00000428892 GYPEP15421 78 aa7.42□□□□□ -1.22
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