RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000416021.5

SH3BP4-204, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP4, Length 593 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-204ENST00000416021 M0QY20 66 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SRSF3P84103 164 aaKnown RBP14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CNFNQ9BYD5 112 aa14.19□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 C16orf90A8MZG2 172 aa14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM241Q24JQ0 296 aa14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 DPH3P1Q9H4G8 78 aa14.18□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 H7C1H1 209 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM74A3Q4VXF1 159 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SUMO4Q6EEV6 95 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 NIT1Q86X76 327 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 Q9HAA7 133 aa14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.17□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 EREGO14944 169 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 KRTAP10-2P60368 255 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 CT83Q5H943 113 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 PGLYRP4Q96LB8 373 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 DNAJC30Q96LL9 226 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 SMDT1Q9H4I9 107 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 OSTCQ9NRP0 149 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.16□□□□□ -0.14
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A087WTM6 91 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 LAGE3Q14657 143 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 RASL11AQ6T310 242 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 KIAA1109Q2LD37 5005 aa14.14□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM262E9PQX1 116 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PSCAO43653 123 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM15Q7Z3B0 74 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TSKUQ8WUA8 353 aa14.13□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 A0A087WX48 190 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 RPL23P62829 140 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM97Q5BJF2 176 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 KCNIP4Q6PIL6 250 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 NTM-AS1Q6ZSK4 140 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 C15orf54Q8N8G6 183 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ISOC2Q96AB3 205 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 NIT2Q9NQR4 276 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.12□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CHCHD7Q9BUK0 85 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 GFRA4Q9GZZ7 299 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 NAT8Q9UHE5 227 aa14.11□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 HERC2O95714 4834 aa14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 FAM231BA6NCW3 169 aa14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 HIGD1CA8MV81 97 aa14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 BORCS7Q96B45 105 aa14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 TM2D2Q9BX73 214 aa14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 KLK12Q9UKR0 248 aa14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 V9GYV3 84 aa14.1□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB14P61106 215 aa14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ELOBQ15370 118 aa14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 ADIRFQ15847 76 aa14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 GATD1Q8NB37 220 aa14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 CHCHD5Q9BSY4 110 aa14.09□□□□□ -0.15
SH3BP4-204ENST00000416021 LRP1BQ9NZR2 4599 aa14.08□□□□□ -0.16
SH3BP4-204ENST00000416021 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP14.08□□□□□ -0.164e-6■■■□□ 17.3
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SH3BP4-204ENST00000416021 A0A1B0GUT8 65 aa14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4-204ENST00000416021 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.07□□□□□ -0.16
SH3BP4-204ENST00000416021 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4-204ENST00000416021 FRZBQ92765 325 aa14.06□□□□□ -0.16
SH3BP4-204ENST00000416021 UBE2WQ96B02 151 aa14.06□□□□□ -0.16
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SH3BP4-204ENST00000416021 MPV17L2Q567V2 206 aa14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4-204ENST00000416021 ATRAIDQ6UW56 229 aa14.05□□□□□ -0.16
SH3BP4-204ENST00000416021 GAGE6Q13070 117 aa14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4-204ENST00000416021 NUP35Q8NFH5 326 aa14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4-204ENST00000416021 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa14.04□□□□□ -0.16
SH3BP4-204ENST00000416021 COX11Q9Y6N1 276 aa14.04□□□□□ -0.16
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SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM191AQ9H0A3 160 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 NAT8BQ9UHF3 227 aa14.02□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa14.01□□□□□ -0.17
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SH3BP4-204ENST00000416021 ENHOQ6UWT2 76 aa14.01□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CDK2AP2O75956 126 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 COTL1Q14019 142 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 Q8N814 137 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 TMEM243Q9BU79 118 aa14□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 RAB4AP20338 218 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CLLU1Q5K131 121 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 BAALCQ8WXS3 180 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 RNF185Q96GF1 192 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 RYR1P21817 5038 aa13.99□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 GAS8-AS1O95177 125 aa13.97□□□□□ -0.17
SH3BP4-204ENST00000416021 CRPP02741 224 aa13.97□□□□□ -0.17
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