RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384557.1

RNU6-1274P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1274, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1274P, Length 107 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PPP1R17O96001 155 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PRH1P02810 166 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NMBP08949 121 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 COX6A2Q02221 97 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 Q8N8P6 123 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PP6455Q8WZ26 134 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SPANXDQ9BXN6 97 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PROK2Q9HC23 129 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ABCA4P78363 2273 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BICRAQ9NZM4 1560 aa0.4□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 AHNAKQ09666 5890 aaKnown RBP0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SPAARA0A1B0GVQ0 90 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PIN1P1O15428 100 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SNAPC5O75971 98 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CATR1Q13166 79 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 Q5VV11 94 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TTC9CQ8N5M4 171 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SMR3AQ99954 134 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SCN3BQ9NY72 215 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TRPM7Q96QT4 1865 aa0.39□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LOC100130705A0A1B0GUX0 176 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 A0A1B0GV90 55 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DLEU1O43261 78 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SSSCA1O60232 199 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TPPP2P59282 170 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SPAG11BQ08648 103 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SPAG11AQ6PDA7 123 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SMIM4Q8WVI0 70 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NPVFQ9HCQ7 196 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LENEPQ9Y5L5 61 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KDM6BO15054 1643 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa0.38□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TNFP01375 233 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MRPS10P82664 201 aaKnown RBP0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CFAP126Q5VTH2 177 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TMEM203Q969S6 136 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GNG8Q9UK08 70 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KCPQ6ZWJ8 1503 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LOC285556D6RIA3 1793 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 NAV3Q8IVL0 2385 aa0.37□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 A0A0D9SFI3 127 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CTXND1A0A1B0GTU2 59 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FAM24AA6NFZ4 105 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 F6UZH7 168 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 M0R135 149 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CCL18P55774 89 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ESPL1Q14674 2120 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 C9orf153Q5TBE3 101 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 C5orf38Q86SI9 138 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MYOZ3Q8TDC0 251 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 C2orf88Q9BSF0 95 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 IER3IP1Q9Y5U9 82 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 V9GYH0 126 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PPIP5K1Q6PFW1 1433 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MUC16Q8WXI7 14507 aa0.36□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 BCORL1Q5H9F3 1711 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 JMJD1CQ15652 2540 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 CORTO00230 105 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SPINK8P0C7L1 97 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 S100A3P33764 101 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 GNG4P50150 75 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 COMMD6Q7Z4G1 85 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SVBPQ8N300 66 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 FAM213BQ8TBF2 198 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MGST2Q99735 147 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 MBD5Q9P267 1494 aa0.35□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 APCP25054 2843 aa0.34□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa0.34□□□□□ -2.35
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 LOC285095A0A1B0GVY8 99 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ZNF815PA8K554 130 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 OOSP1A8MZH6 123 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 SPINK1P00995 79 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 APOC3P02656 99 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 S100A1P23297 94 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PPP3R1P63098 170 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 COX17Q14061 63 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 DYNLRB1Q9NP97 96 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 TENM3Q9P273 2699 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 PXDNQ92626 1479 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 ABCA1O95477 2261 aa0.34□□□□□ -2.36
RNU6-1274P-201ENST00000384557 KIF13AQ9H1H9 1805 aa0.34□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 54.7 ms