RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370826.3

RABGGTB-202, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RABGGTB, Length 512 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-202ENST00000370826 LCN9Q8WX39 176 aa1.12□□□□□ -2.23
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RABGGTB-202ENST00000370826 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP1.12□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 CCDC88BA6NC98 1476 aa1.12□□□□□ -2.23
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RABGGTB-202ENST00000370826 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP1.11□□□□□ -2.23
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RABGGTB-202ENST00000370826 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
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RABGGTB-202ENST00000370826 MYO5CQ9NQX4 1742 aa1.11□□□□□ -2.23
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RABGGTB-202ENST00000370826 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
RABGGTB-202ENST00000370826 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP1.11□□□□□ -2.23
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RABGGTB-202ENST00000370826 LINC00032P0C843 101 aa1.1□□□□□ -2.23
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RABGGTB-202ENST00000370826 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
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RABGGTB-202ENST00000370826 FN1P02751 2386 aaKnown RBP1.08□□□□□ -2.24
RABGGTB-202ENST00000370826 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP1.08□□□□□ -2.24
RABGGTB-202ENST00000370826 RGPD2P0DJD1 1756 aa1.08□□□□□ -2.24
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