RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356331.9

SH3BP2-201, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP2, Length 9,211 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-201ENST00000356331 TRAV4A0A0B4J268 109 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-201ENST00000356331 C17orf58Q2M2W7 97 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-201ENST00000356331 IGFL3Q6UXB1 125 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-201ENST00000356331 C11orf1Q9H5F2 150 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-201ENST00000356331 MSMBP08118 114 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-201ENST00000356331 COX7CP15954 63 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-201ENST00000356331 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-201ENST00000356331 THSD7BQ9C0I4 1608 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-201ENST00000356331 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa8.28□□□□□ -1.08
SH3BP2-201ENST00000356331 C1orf195Q5TG92 126 aa8.28□□□□□ -1.08
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SH3BP2-201ENST00000356331 PIK3CD-AS1Q5SR53 167 aa8.2□□□□□ -1.1
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SH3BP2-201ENST00000356331 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP2-201ENST00000356331 LINC00694P0DN24 101 aa8.2□□□□□ -1.1
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SH3BP2-201ENST00000356331 GPHB5Q86YW7 130 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP2-201ENST00000356331 CFAP126Q5VTH2 177 aa8.19□□□□□ -1.1
SH3BP2-201ENST00000356331 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.19□□□□□ -1.1
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SH3BP2-201ENST00000356331 SPRY2O43597 315 aa8.19□□□□□ -1.1
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