RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000222266.2

PSENEN-201, Transcript of presenilin enhancer, gamma-secretase subunit, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PSENEN, Length 603 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSENEN-201ENST00000222266 C10orf91Q5T1B1 145 aa7.08□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.08□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 MUC4Q99102 2169 aa7.08□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 PPBPP02775 128 aa7.07□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 ESRGQ1W209 222 aa7.07□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 LELP1Q5T871 98 aa7.07□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 SUMO4Q6EEV6 95 aa7.07□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 UPK3BQ9BT76 320 aa7.07□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 Q9H8V8 135 aa7.07□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 LINC00588Q9Y4M8 146 aa7.07□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa7.07□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 C7orf77A4D0Y5 90 aa7.06□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 M0QY20 66 aa7.06□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 SIVA1O15304 175 aa7.06□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 ADCYAP1P18509 176 aa7.06□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 Q6ZSN1 163 aa7.06□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.06□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 TENM2Q9NT68 2774 aa7.05□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa7.05□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 TCAPO15273 167 aa7.05□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 BTF3P20290 206 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 CKS2P33552 79 aa7.05□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 UBE2D3P61077 147 aa7.05□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 UBE2D2P62837 147 aa7.05□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 SMAGPQ0VAQ4 97 aa7.05□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 ELOBQ15370 118 aa7.05□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa7.05□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 ST20Q9HBF5 79 aa7.05□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa7.04□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 A0A087WX48 190 aa7.04□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.04□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 RAB4AP20338 218 aa7.04□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 LINC00315P59091 139 aa7.04□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 COTL1Q14019 142 aa7.04□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 FAM104BQ5XKR9 115 aa7.04□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa7.03□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 UBE2L6O14933 153 aa7.03□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 NCR2O95944 276 aa7.03□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 PMCHP20382 165 aa7.03□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 AMN1Q8IY45 258 aa7.03□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 GATD1Q8NB37 220 aa7.03□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 KIR2DL4Q99706 377 aa7.03□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 CHCHD7Q9BUK0 85 aa7.03□□□□□ -1.28
PSENEN-201ENST00000222266 TRBV6-8A0A0A6YYG3 113 aa7.02□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa7.02□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 A0A1B0GXF2 115 aa7.02□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 TMEM262E9PQX1 116 aa7.02□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 I3L3M4 83 aa7.02□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 VCYO14598 125 aa7.02□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 HLA-DQA1P01909 254 aa7.02□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 MT-ND6P03923 174 aa7.02□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 FCER1GP30273 86 aa7.02□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 NFE4Q86UQ8 179 aa7.02□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 ORMDL3Q8N138 153 aa7.02□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 C20orf78Q9BR46 151 aa7.02□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 CHCHD5Q9BSY4 110 aa7.02□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 LAMTOR2Q9Y2Q5 125 aa7.02□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 IGLV2-18A0A075B6J9 118 aa7.01□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.01□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 TRBV6-5A0A0K0K1A5 114 aa7.01□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 SDHAF1A6NFY7 115 aa7.01□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 PHOX2AO14813 284 aa7.01□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 LINC00694P0DN24 101 aa7.01□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 AMTP48728 403 aa7.01□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 TMEM136Q6ZRR5 245 aa7.01□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.01□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 TMEM18Q96B42 140 aa7.01□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 SMCO4Q9NRQ5 59 aa7.01□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 DNAH7Q8WXX0 4024 aa7□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 M0R2N4 97 aa7□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 APCSP02743 223 aa7□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 RAB5AP20339 215 aa7□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 G0S2P27469 103 aa7□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 LINC01556Q5JQF7 62 aa7□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 C1orf134Q5TEV5 83 aa7□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 TMEM243Q9BU79 118 aa7□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 GNB1LQ9BYB4 327 aa7□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 D6R8Y8 96 aa6.99□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 H7C423 109 aa6.99□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 IQCJQ1A5X6 159 aa6.99□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 AMMECR1LQ6DCA0 310 aa6.99□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 RMI2Q96E14 147 aa6.99□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 RNF185Q96GF1 192 aa6.99□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 PRELID3AQ96N28 172 aa6.99□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 COX11Q9Y6N1 276 aa6.99□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 NACAE9PAV3 2078 aa6.98□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 TRBV24-1A0A075B6N3 115 aa6.98□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.98□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 TNFRSF6BO95407 300 aa6.98□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 WFDC10BQ8IUB3 73 aa6.98□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 TMEM101Q96IK0 257 aa6.98□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 TMEM70Q9BUB7 260 aa6.98□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 TM2D2Q9BX73 214 aa6.98□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 MAP1LC3AQ9H492 121 aa6.98□□□□□ -1.29
PSENEN-201ENST00000222266 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.98□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.8 ms