RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551525.5

PTPRB-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 5,291 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-35A0A0C4DH35 117 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF329Q86UD4 541 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 AJUBAQ96IF1 538 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 F8WEM9 126 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 OVOL3O00110 214 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 LEPROTO15243 131 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV4-31P0DP07 118 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF726P1Q15940 193 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 Q6JHZ5 121 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 SDIM1Q6ZPB5 146 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 WDR86Q86TI4 376 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 C3orf84H3BNL1 204 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 CD24P25063 80 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 C2orf16Q68DN1 1984 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-49A0A0A0MS15 119 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 INS-IGF2F8WCM5 200 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 H3BQ85 93 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 SPRY2O43597 315 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV4-59P01825 116 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 Q8N8P6 123 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 C4orf3Q8WVX3 66 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 CLEC2BQ92478 149 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 C2CD3Q4AC94 2353 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3OR16-13A0A075B7E8 117 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-74A0A0B4J1X5 117 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 CASC2Q6XLA1 102 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 ZNRD1Q9P1U0 126 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 COL5A1P20908 1838 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 CCL18P55774 89 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV3-66A0A0C4DH42 116 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 DEFB131AP59861 70 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 Q6ZR03 302 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRB-210ENST00000551525 SOSTDC1Q6X4U4 206 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 LINC00173Q6ZV60 143 aa4.88□□□□□ -1.63
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PTPRB-210ENST00000551525 SS18Q15532 418 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRB-210ENST00000551525 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRB-210ENST00000551525 LYPD6Q86Y78 171 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRB-210ENST00000551525 XCL2Q9UBD3 114 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRB-210ENST00000551525 DAND5Q8N907 189 aa4.87□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 NPBQ8NG41 125 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRB-210ENST00000551525 SPG11Q96JI7 2443 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 FXYD7P58549 80 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 HIST2H2BDQ6DRA6 164 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 ZNF581Q9P0T4 197 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 MYLKQ15746 1914 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 C5orf63A6NC05 138 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 QRFPP83859 136 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRB-210ENST00000551525 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
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PTPRB-210ENST00000551525 HILS1P60008 231 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 Q6YL49 198 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 ZFP2Q6ZN57 461 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 S4R3C0 116 aa4.86□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 TMEM131Q92545 1883 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 K7EMT4 169 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 LHBP01229 141 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 NFE4Q86UQ8 179 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 NUPR2A6NF83 97 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 LY6G6CO95867 125 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 FAM19A4Q96LR4 140 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 MIFP14174 115 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 SEM1Q6ZVN7 128 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 CACNA1DQ01668 2161 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-210ENST00000551525 FASNP49327 2511 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
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