RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524384.5

PTP4A2-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase type IVA, member 2, human

TSL 5

Gene PTP4A2, Length 663 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTP4A2-208	ENST00000524384	GCSAML	Q5JQS6	135 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	MIR17HG	Q75NE6	70 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	FER1L6-AS1	Q8NA97	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	RPL36AL	Q969Q0	106 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	RAB26	Q9ULW5	256 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	TRBV10-1	A0A0K0K1A3	114 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	SCGB1D2	O95969	90 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	S100A10	P60903	97 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	REG3A	Q06141	175 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	PPP1R1A	Q13522	171 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM74A4	Q5TZK3	123 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	AP3S1	Q92572	193 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	DIRC1	Q969H9	104 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	DIRAS2	Q96HU8	199 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	BCL7B	Q9BQE9	202 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	GFRA4	Q9GZZ7	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	VCX3B	Q9H321	246 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	UQCC1	Q9NVA1	299 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	UBE2L5P	A0A1B0GUS4	154 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	C7orf66	A4D0T2	115 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384		P01737	135 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	MT-ND6	P03923	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	GZMB	P10144	247 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	RAB5C	P51148	216 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	VBP1	P61758	197 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	BAX	Q07812	192 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	C15orf56	Q8N910	161 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	HYLS1	Q96M11	299 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	NMES1	Q9C002	83 aa		4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	TMA7	Q9Y2S6	64 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	TSPAN13	O95857	204 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	UBE2D1	P51668	147 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	HIGD2B	Q4VC39	106 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	C1orf137	Q5JT78	98 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	GOLT1A	Q6ZVE7	132 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	SUN5	Q8TC36	379 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	MIXL1	Q9H2W2	232 aa		4.85	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384		H0Y9J4	135 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR7C2	O60412	319 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	CST7	O76096	145 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	UBE2L3	P68036	154 aa	Known RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	GAGE6	Q13070	117 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	CFAP161	Q6P656	301 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR10G8	Q8NGN5	311 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	CMTM2	Q8TAZ6	248 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	LYRM2	Q9NU23	88 aa	Predicted RBP	4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	OR5AC2	Q9NZP5	309 aa		4.84	□□□□□ -1.63
PTP4A2-208	ENST00000524384	GCG	P01275	180 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	MBP	P02686	304 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	FGF7	P21781	194 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	IL18	Q14116	193 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	IAH1	Q2TAA2	248 aa	Predicted RBP	4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	SPANXN2	Q5MJ10	180 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	NTM-AS1	Q6ZSK4	140 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	ARL6IP6	Q8N6S5	226 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	MCFD2	Q8NI22	146 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	NDFIP1	Q9BT67	221 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	OTOR	Q9NRC9	128 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	PKIG	Q9Y2B9	76 aa		4.83	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384		L7N2F9	121 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	RGS5	O15539	181 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	IGLV7-43	P04211	117 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	BCAP31	P51572	246 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	RAB2A	P61019	212 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	VAMP2	P63027	116 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.82	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	MITD1	Q8WV92	249 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	FUNDC2	Q9BWH2	189 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	NPCDR1	Q9BY65	106 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	IL36B	Q9NZH7	164 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		4.82	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	GVQW2	A0A096LPI5	108 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	C9orf170	A2RU37	121 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	S100A11	P31949	105 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAU	P35544	74 aa	Known RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	FAM74A1	Q5RGS3	127 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	C20orf203	Q8NBC4	194 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	SFRP2	Q96HF1	295 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	4.81	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	MUC17	Q685J3	4493 aa		4.81	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	TRBV25-1	A0A075B6N4	114 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	TRAV6	A0A075B6T7	132 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384		H3BVH4	76 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	CTDSP2	O14595	271 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	CRYGA	P11844	174 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	GNG5	P63218	68 aa		4.8	□□□□□ -1.64
PTP4A2-208	ENST00000524384	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	4.8	□□□□□ -1.64

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