RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512290.2

MSC-AS1-202, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3

Gene MSC-AS1, Length 832 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-202ENST00000512290 CHAC1Q9BUX1 264 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 MAP1LC3BQ9GZQ8 125 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa4.87□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 C7orf71A4D174 169 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 LRCOL1A6NCL2 159 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 J3KRW8 73 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 BCL2P10415 239 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 FGF8P55075 233 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 TAS2R45P59539 299 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 ERCC8Q13216 396 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 KHDC3LQ587J8 217 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAM122CQ6P4D5 195 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 Q6ZTI0 123 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 OR10G4Q8NGN3 311 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 OR10G9Q8NGN4 311 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 OR10G7Q8NGN6 311 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 LINC00477Q96M19 166 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 PYGO2Q9BRQ0 406 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 ACTR3CQ9C0K3 210 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 GNG13Q9P2W3 67 aa4.86□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 TNXBP22105 4242 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 RBAKDNA6NC62 111 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 LECT2O14960 151 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 NDUFS6O75380 124 aaKnown RBP4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF324O75467 553 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 EIF3GO75821 320 aaKnown RBP eCLIP4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 IFNA1P01562 189 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGHV3-53P01767 116 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 SRIP30626 198 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 CDC34P49427 236 aaPredicted RBP4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 SLAQ13239 276 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMEM78Q5T7P6 136 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRR9Q5T870 116 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 PQLC2Q6ZP29 291 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 WFDC10BQ8IUB3 73 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 CBLN2Q8IUK8 224 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 C11orf72Q8NBR9 251 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 Q8TAT8 98 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 VGLL1Q99990 258 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 TM2D2Q9BX73 214 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF492Q9P255 531 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 HHLA3Q9XRX5 114 aa4.85□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGLV2-11P01706 119 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 GPX1P07203 203 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 ZNF138P52744 262 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 RANP62826 216 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 DAZ2Q13117 558 aaKnown RBP4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 Q6ZSA8 131 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 CYB561D1Q8N8Q1 229 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 PRO0255Q9UI72 69 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 VAX2Q9UIW0 290 aa4.84□□□□□ -1.63
MSC-AS1-202ENST00000512290 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 A0A1W2PPV4 95 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 C7orf77A4D0Y5 90 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 M0R036 132 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 HMGB3O15347 200 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 STAG3L2P0CL84 134 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 STAG3L3P0CL85 134 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 ARL14EPLP0DKL9 152 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 CSN1S1P47710 185 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 TCL1AP56279 114 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 RHEBQ15382 184 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 TDRG1Q3Y452 100 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 LCE1EQ5T753 118 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 Q6ZQT7 251 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 MANBALQ9NQG1 85 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 OTORQ9NRC9 128 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 SMCO4Q9NRQ5 59 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 LENEPQ9Y5L5 61 aa4.83□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa4.82□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 A0A0U1RQV1 116 aa4.82□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 TMEM250H0YL14 139 aa4.82□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 MT1HL1P0DM35 61 aa4.82□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 AKR1C3P42330 323 aa4.82□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 Q6AWC8 147 aa4.82□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa4.82□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 CMTM2Q8TAZ6 248 aa4.82□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 TVP23CQ96ET8 276 aa4.82□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 DPH3Q96FX2 82 aa4.82□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 RPS10P5Q9NQ39 176 aa4.82□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa4.81□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa4.81□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa4.81□□□□□ -1.64
MSC-AS1-202ENST00000512290 PGPA6NDG6 321 aa4.81□□□□□ -1.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 61.6 ms