RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000497977.1

PTPRN-218, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRN, Length 701 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-218ENST00000497977 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
PTPRN-218ENST00000497977 CFAP126Q5VTH2 177 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRN-218ENST00000497977 LYPD5Q6UWN5 251 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRN-218ENST00000497977 C15orf54Q8N8G6 183 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRN-218ENST00000497977 NUDT10Q8NFP7 164 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRN-218ENST00000497977 ZNRF2Q8NHG8 242 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRN-218ENST00000497977 NUDT11Q96G61 164 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRN-218ENST00000497977 LY96Q9Y6Y9 160 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRN-218ENST00000497977 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 TMEM218A2RU14 115 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 K7EQD1 137 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 M0R381 172 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 SIVA1O15304 175 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7.21□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 EVI2AP22794 236 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 SPANXN1Q5VSR9 72 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 F2Z2F3 143 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 TIRAPP58753 221 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 NFE4Q86UQ8 179 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 SLC7A5P1Q8MH63 180 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 C6orf223Q8N319 242 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 OR10AG1Q8NH19 301 aa7.2□□□□□ -1.26
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PTPRN-218ENST00000497977 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 MUC4Q99102 2169 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 A0A087WWC5 75 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 Q6ZR54 194 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 FAM231DQ6ZW35 169 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 C10orf126Q8N4M7 172 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 OR10G8Q8NGN5 311 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 BIRC6Q9NR09 4857 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 PRSS29PA6NIE9 313 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 OR5AL1P0C617 328 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 CACNG7P62955 275 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 FAM74A4Q5TZK3 123 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 KCNIP4Q6PIL6 250 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 SEC11CQ9BY50 192 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 OSTCQ9NRP0 149 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 V9GYV3 84 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 NACAE9PAV3 2078 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 EREGO14944 169 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 NXPH4O95158 308 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 IGLC6P0CF74 106 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 NDUFA5Q16718 116 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 OR10J3Q5JRS4 329 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 LYZL1Q6UWQ5 148 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 SMIM15Q7Z3B0 74 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 GTSF1Q8WW33 167 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 PGLYRP4Q96LB8 373 aa7.17□□□□□ -1.26
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PTPRN-218ENST00000497977 GTSF1LQ9H1H1 148 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 A0A087WWL8 130 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 A8MWL6 223 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 F5H697 171 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 H7C1H1 209 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 SNAI2O43623 268 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 APOC3P02656 99 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRN-218ENST00000497977 CTRLP40313 264 aa7.16□□□□□ -1.26
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PTPRN-218ENST00000497977 CT83Q5H943 113 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 WDR73Q6P4I2 378 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 BORCS7Q96B45 105 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 JPT2Q9H910 190 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa7.15□□□□□ -1.26
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PTPRN-218ENST00000497977 MT-ND4LP03901 98 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 TRGC1P0CF51 173 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 TMEM97Q5BJF2 176 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 LELP1Q5T871 98 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 ZNF575Q86XF7 245 aa7.15□□□□□ -1.26
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PTPRN-218ENST00000497977 AP1S3Q96PC3 154 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 CARHSP1Q9Y2V2 147 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.15□□□□□ -1.26
PTPRN-218ENST00000497977 PPP1R2P9O14990 202 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRN-218ENST00000497977 PKIAP61925 76 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRN-218ENST00000497977 ELOBQ15370 118 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRN-218ENST00000497977 TWIST1Q15672 202 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRN-218ENST00000497977 ZNF56Q15929 161 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRN-218ENST00000497977 CLRN3Q8NCR9 226 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRN-218ENST00000497977 SAMD10Q9BYL1 202 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRN-218ENST00000497977 MSRB1Q9NZV6 116 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRN-218ENST00000497977 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRN-218ENST00000497977 GAGE12JA6NER3 117 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRN-218ENST00000497977 CRYGDP07320 174 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRN-218ENST00000497977 DNAH10OSP0CZ25 163 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRN-218ENST00000497977 GAGE1Q13065 139 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRN-218ENST00000497977 GAGE4Q13068 117 aa7.13□□□□□ -1.27
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