RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481242.5

GARNL3-216, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 2

Gene GARNL3, Length 4,816 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-216ENST00000481242 TM2D2Q9BX73 214 aa7.34□□□□□ -1.23
GARNL3-216ENST00000481242 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa7.34□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 NDUFA11Q86Y39 141 aa7.34□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 NCKAP5O14513 1909 aa7.34□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 NPYP01303 97 aa7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 IGLV2-23P01705 113 aa7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 PFN2P35080 140 aa7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 ATOX1O00244 68 aa7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 SCRT2Q9NQ03 307 aa7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 NCOA6Q14686 2063 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 C15orf53Q8NAA6 179 aa7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 C17orf77Q96MU5 243 aa7.33□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 DNAJC9-AS1A6NH13 148 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 NACAE9PAV3 2078 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 ODF3BA8MYP8 253 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 GNRH2O43555 120 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 RPL32P62910 135 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 APRG1Q8IVJ8 170 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 C9JAW5 83 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 MSMPQ1L6U9 139 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 TDRG1Q3Y452 100 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 ZNF843Q8N446 348 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 HLA-DMBP28068 263 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 ABCA2Q9BZC7 2435 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 ADAMTS9Q9P2N4 1935 aa7.32□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 K7EQD1 137 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 IGF1P05019 195 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 A0A0J9YY99 117 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 J3QQQ9 107 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 GYPEP15421 78 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 ODF3L1Q8IXM7 274 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 CFHR4Q92496 578 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 CRLF1O75462 422 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 DYSFO75923 2080 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 Q6YL49 198 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 Q6ZVH6 145 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 SLC25A29Q8N8R3 303 aa7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 MRPL35Q9NZE8 188 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 IGLL5B9A064 214 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 SOCS3O14543 225 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 IGHV4-31P0DP07 118 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 C12orf74Q32Q52 190 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 PRR31Q5SQ13 230 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 Q6ZUT4 128 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 K7EN84 100 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 LINC01545Q5VT33 79 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 PATE2Q6UY27 113 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 ANKRD29Q8N6D5 301 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 DSCAMO60469 2012 aa7.3□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 CHD3Q12873 2000 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
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GARNL3-216ENST00000481242 TMEM131Q92545 1883 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 LGALS9O00182 355 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 NXPH4O95158 308 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 CTRLP40313 264 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 UBE2BP63146 152 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 A0A096LPF7 62 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 FANCD2OSQ96PS1 177 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 C19orf84I3L1E1 186 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 TMEM61Q8N0U2 210 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 OBSL1O75147 1896 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 SMIM9A6NGZ8 99 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 UQCRQO14949 82 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 EBI3Q14213 229 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 C11orf1Q9H5F2 150 aa7.29□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 ODF3Q96PU9 254 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 WISP2O76076 250 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 ZNF503Q96F45 646 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 FAM167A-AS1Q96KT0 104 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 XCL1P47992 114 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 PRR14LQ5THK1 2151 aa7.28□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 A0A0J9YX75 114 aa7.27□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 COX7A2LO14548 114 aa7.27□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 PRO0255Q9UI72 69 aa7.27□□□□□ -1.24
GARNL3-216ENST00000481242 C10orf142B7Z368 130 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-216ENST00000481242 PRO1854Q9UHT4 67 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-216ENST00000481242 HHLA3Q9XRX5 114 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-216ENST00000481242 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-216ENST00000481242 CXCL5P42830 114 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-216ENST00000481242 Q6Q795 121 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-216ENST00000481242 CAMK2N2Q96S95 79 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-216ENST00000481242 C11orf71Q6IPW1 123 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-216ENST00000481242 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-216ENST00000481242 C20orf173Q96LM9 149 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-216ENST00000481242 Q9HAA7 133 aa7.27□□□□□ -1.25
GARNL3-216ENST00000481242 CHD8Q9HCK8 2581 aa7.26□□□□□ -1.25
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