RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455609.1

C9orf41-AS1-201, C9orf41 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene C9orf41-AS1, Length 719 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 Q9UF83 564 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRP1BQ9NZR2 4599 aa10.53□□□□□ -0.72
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBR4Q5T4S7 5183 aa10.52□□□□□ -0.72
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A087WWL8 130 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TEX46H3BTG2 121 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LINC00694P0DN24 101 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LELP1Q5T871 98 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PRR27Q6MZM9 219 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AKAP14Q86UN6 197 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZFP82Q8N141 532 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C10orf126Q8N4M7 172 aa10.52□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LINC01556Q5JQF7 62 aa10.51□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CXCL1P09341 107 aa10.5□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ERVFC1-1P60608 527 aa10.5□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CENPWQ5EE01 88 aa10.49□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C9orf62Q8N4C0 152 aa10.49□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR10AG1Q8NH19 301 aa10.49□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BOLA1Q9Y3E2 137 aa10.49□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DNAH5Q8TE73 4624 aa10.49□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 EREGO14944 169 aa10.48□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SNAI2O43623 268 aa10.48□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IFNA1P01562 189 aa10.48□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGHV3-30P01768 117 aa10.48□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGHV3-33P01772 117 aa10.48□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa10.48□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa10.48□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BCL2P10415 239 aa10.48□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A087WTM6 91 aa10.47□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAB19A4D1S5 217 aa10.47□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa10.47□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PDE6DO43924 150 aa10.47□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDK2AP2O75956 126 aa10.47□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGLV2-8P01709 118 aa10.47□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP10.47□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 HSPG2P98160 4391 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MUC21A0A140T8X8 626 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR5AL1P0C617 328 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP10.46□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 Q8N3U1 123 aa10.46□□□□□ -0.73
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GNG4P50150 75 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SPANXN1Q5VSR9 72 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 Q9HAA7 133 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MED9Q9NWA0 146 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 VAX2Q9UIW0 290 aa10.45□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A087WWC5 75 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SSTP61278 116 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ZNF56Q15929 161 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP10.44□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMIM12Q96EX1 92 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.44□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 APOBP04114 4563 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 C19orf71A6NCJ1 209 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 PSCAO43653 123 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 GZMBP10144 247 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RAB4BP61018 213 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ALKAL2Q6UX46 152 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR2D3Q8NGH3 330 aa10.43□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP10.43□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 A0A1B0GVG6 124 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP10.42□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBE2D3P61077 147 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 UBE2D2P62837 147 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LAGE3Q14657 143 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 CDPF1Q6NVV7 123 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TPPP3Q9BW30 176 aa10.42□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RBFOX3A6NFN3 312 aa10.41□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 IGLC6P0CF74 106 aa10.41□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 RPS20P60866 119 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa10.41□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.41□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 OR10G8Q8NGN5 311 aa10.41□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP10.41□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 ABCA13Q86UQ4 5058 aa10.41□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LRCOL1A6NCL2 159 aa10.4□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 P01737 135 aa10.4□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 AP1S3Q96PC3 154 aa10.4□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa10.4□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa10.4□□□□□ -0.74
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 F5H697 171 aa10.39□□□□□ -0.75
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 SMIM17P0DL12 118 aa10.39□□□□□ -0.75
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NKX2-5P52952 324 aaPredicted RBP10.39□□□□□ -0.75
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BLOC1S1P78537 153 aa10.39□□□□□ -0.75
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NIT1Q86X76 327 aa10.39□□□□□ -0.75
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa10.39□□□□□ -0.75
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 BIN3Q9NQY0 253 aa10.39□□□□□ -0.75
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 XKRY2A2RUG3 117 aa10.38□□□□□ -0.75
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa10.38□□□□□ -0.75
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa10.37□□□□□ -0.75
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 TOR2AQ5JU69 321 aa10.37□□□□□ -0.75
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NUDT10Q8NFP7 164 aa10.37□□□□□ -0.75
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 LYPD6BQ8NI32 183 aa10.37□□□□□ -0.75
C9orf41-AS1-201ENST00000455609 NUDT11Q96G61 164 aa10.37□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 194.7 ms