RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000445304.1

RPL17P1-201, Transcript of ribosomal protein L17 pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene RPL17P1, Length 536 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P1-201ENST00000445304 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.33□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 DNAH5Q8TE73 4624 aa6.33□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 HSPG2P98160 4391 aa6.32□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa6.32□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 M0R381 172 aa6.32□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 CDK2AP2O75956 126 aa6.32□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 RPL35P42766 123 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 ERVFC1-1P60608 527 aa6.32□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 CCL20P78556 96 aa6.32□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 OR10J3Q5JRS4 329 aa6.32□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 SFRP2Q96HF1 295 aa6.32□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 SAMD10Q9BYL1 202 aa6.32□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 TNFRSF18Q9Y5U5 241 aa6.32□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 GAGE12JA6NER3 117 aa6.31□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 EREGO14944 169 aa6.31□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 KRTAP10-2P60368 255 aa6.31□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 GAGE1Q13065 139 aa6.31□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 GAGE4Q13068 117 aa6.31□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 GAGE5Q13069 117 aa6.31□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 GAGE13Q4V321 117 aa6.31□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 FAM74A4Q5TZK3 123 aa6.31□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 AKAP14Q86UN6 197 aa6.31□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 SMIM12Q96EX1 92 aa6.31□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 HERC1Q15751 4861 aa6.31□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 A0A087WWC5 75 aa6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 A0A087WWL8 130 aa6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 SNAI2O43623 268 aa6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 PDE6DO43924 150 aa6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 IFNA1P01562 189 aa6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 OR5AL1P0C617 328 aa6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 RPL19P84098 196 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 PRR27Q6MZM9 219 aa6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 DERL1Q9BUN8 251 aa6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 APOBP04114 4563 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 A0A087WTM6 91 aa6.29□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa6.29□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 BCL2P10415 239 aa6.29□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 LAGE3Q14657 143 aa6.29□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 CENPWQ5EE01 88 aa6.29□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.29□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 C9orf62Q8N4C0 152 aa6.29□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 OR10AG1Q8NH19 301 aa6.29□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 Q9UF83 564 aa6.29□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 VAX2Q9UIW0 290 aa6.29□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 GNG4P50150 75 aa6.28□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 RAB4BP61018 213 aa6.28□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 SPANXN1Q5VSR9 72 aa6.28□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 LINC00528Q8N1L1 170 aa6.28□□□□□ -1.4
RPL17P1-201ENST00000445304 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 RAB19A4D1S5 217 aa6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 C19orf71A6NCJ1 209 aa6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 PSCAO43653 123 aa6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 IGLV2-8P01709 118 aa6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 IGHV3-30P01768 117 aa6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 IGHV3-33P01772 117 aa6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 RPS20P60866 119 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 LCE2CQ5TA81 110 aa6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 BIN3Q9NQY0 253 aa6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 MED9Q9NWA0 146 aa6.27□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa6.26□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 XKRY2A2RUG3 117 aa6.26□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 UBE2D3P61077 147 aa6.26□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 UBE2D2P62837 147 aa6.26□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 ZNF56Q15929 161 aa6.26□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 TOR2AQ5JU69 321 aa6.26□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa6.26□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 OR10G8Q8NGN5 311 aa6.26□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 AP1S3Q96PC3 154 aa6.26□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 Q9HAA7 133 aa6.26□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa6.25□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa6.25□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 MUC21A0A140T8X8 626 aa6.25□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 LRCOL1A6NCL2 159 aa6.25□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 P01737 135 aa6.25□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 IGLC6P0CF74 106 aa6.25□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 SMIM17P0DL12 118 aa6.25□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 BLOC1S1P78537 153 aa6.25□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 NIT1Q86X76 327 aa6.25□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 OR2D3Q8NGH3 330 aa6.25□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 TM2D2Q9BX73 214 aa6.25□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa6.25□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 F2Z2F3 143 aa6.24□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 GZMBP10144 247 aa6.24□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 CACNG7P62955 275 aa6.24□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 ALKAL2Q6UX46 152 aa6.24□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP6.24□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 Q8N3U1 123 aa6.24□□□□□ -1.41
RPL17P1-201ENST00000445304 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa6.24□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms