RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384160.1

RNU6-1008P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1008, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1008P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CHMP5Q9NZZ3 219 aa-4.81□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ERG28Q9UKR5 140 aa-4.81□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UFC1Q9Y3C8 167 aa-4.81□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa-4.81□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C4AP0C0L4 1744 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C4BP0C0L5 1744 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RER1O15258 196 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IFNA16P05015 189 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CXCL3P19876 107 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCL18P55774 89 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RGS8P57771 180 aaPredicted RBP-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MRPS36P82909 103 aaKnown RBP-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 Q6ZT83 130 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MRPL52Q86TS9 123 aaKnown RBP-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HDDC3Q8N4P3 179 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ATP6V1E2Q96A05 226 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RSPH9Q9H1X1 276 aaPredicted RBP-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TPT1P8Q9HAU6 139 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRTFDC1Q9NRG1 225 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 IMP3Q9NV31 184 aaKnown RBP-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SMPXQ9UHP9 88 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 R4GMQ9 66 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DOCK2Q92608 1830 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ANKRD36A6QL64 1941 aa-4.82□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PRDM2Q13029 1718 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC169A6NNP5 214 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OTCP00480 354 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AIF1P55008 147 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 COTL1Q14019 142 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C1orf195Q5TG92 126 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ULK3Q6PHR2 472 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC91Q7Z6B0 441 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NRGNQ92686 78 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC77Q9BR77 488 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa-4.83□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PNMA8CA0A1B0GUJ8 204 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 STX10O60499 249 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC170Q8IYT3 715 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DEFB106AQ8N104 65 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 POLE3Q9NRF9 147 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NCAPD3P42695 1498 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MBD5Q9P267 1494 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa-4.84□□□□□ -3.18
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UNC80Q8N2C7 3258 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PBRM1Q86U86 1689 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TRAV2A0A0B4J234 112 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SPAG6O75602 509 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RANBP1P43487 201 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RABIFP47224 123 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DYNLT3P51808 116 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 LYRM7Q5U5X0 104 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 STOML3Q8TAV4 291 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AP3S1Q92572 193 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC35B3Q9H1N7 401 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NINJ2Q9NZG7 142 aa-4.85□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CEP164Q9UPV0 1460 aa-4.86□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 DAPL1A0PJW8 107 aa-4.86□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 K7EN84 100 aa-4.86□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FIBPO43427 364 aa-4.86□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 ADCYAP1P18509 176 aa-4.86□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SMAGPQ0VAQ4 97 aa-4.86□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 FKBP1CQ5VVH2 108 aa-4.86□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 EXO5Q9H790 373 aa-4.86□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 RMND1Q9NWS8 449 aa-4.86□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 V9GYY9 64 aa-4.86□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MYH1P12882 1939 aa-4.86□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NLRP1Q9C000 1473 aa-4.87□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TFF1P04155 84 aa-4.87□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CCDC152Q4G0S7 254 aa-4.87□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NMSQ5H8A3 153 aa-4.87□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 C6orf183Q5T699 404 aa-4.87□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 KRT222Q8N1A0 295 aa-4.87□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR6N2Q8NGY6 317 aa-4.87□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMBIM4Q9HC24 238 aa-4.87□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP-4.87□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 NUP210LQ5VU65 1888 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 AIPO00170 330 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 HPGDSO60760 199 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 PPP1R17O96001 155 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 APOC3P02656 99 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 CRYBA4P53673 196 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 UBE2G2P60604 165 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 Q6AWC8 147 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 SLC51BQ86UW2 128 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 COMMD1Q8N668 190 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 MCEEQ96PE7 176 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 TMEM237Q96Q45 408 aa-4.88□□□□□ -3.19
RNU6-1008P-201ENST00000384160 OR2J1Q9GZK6 312 aa-4.88□□□□□ -3.19
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.3 ms