RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000382940.8

NME4-202, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 4, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene NME4, Length 766 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME4-202ENST00000382940 IGHV3-30P01768 117 aa14.69□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 IGHV3-33P01772 117 aa14.69□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa14.69□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa14.69□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 IFNA1P01562 189 aa14.68□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 C1QBP02746 253 aa14.68□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 SULT1A2P50226 295 aa14.68□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 RPL19P84098 196 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 SLC51BQ86UW2 128 aa14.68□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 MLST8Q9BVC4 326 aa14.68□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa14.68□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 Q9HAA7 133 aa14.67□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 A0A087WTM6 91 aa14.66□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 A0A087WWC5 75 aa14.66□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 Q6ZNX1 250 aa14.66□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 AKAP14Q86UN6 197 aa14.66□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 C11orf52Q96A22 123 aa14.66□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 DERL1Q9BUN8 251 aa14.66□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 IBA57-AS1B1ANH7 110 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 CXCL1P09341 107 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 LINC00694P0DN24 101 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 CDPF1Q6NVV7 123 aa14.65□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
NME4-202ENST00000382940 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa14.64□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 PDE6DO43924 150 aa14.64□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 CENPWQ5EE01 88 aa14.64□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 SPANXN1Q5VSR9 72 aa14.64□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 OR10AG1Q8NH19 301 aa14.64□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 DAZAP1Q96EP5 407 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 Q9UF83 564 aa14.64□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 ZNF56Q15929 161 aa14.63□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 GNG4P50150 75 aa14.62□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 SSTP61278 116 aa14.62□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 RPL36AP83881 106 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa14.62□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 RPL36ALQ969Q0 106 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa14.62□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa14.62□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 MUC21A0A140T8X8 626 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 OR5AL1P0C617 328 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 FUSP35637 526 aaKnown RBP eCLIP14.61□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 LAGE3Q14657 143 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 MED9Q9NWA0 146 aa14.61□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 SNAI2O43623 268 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 BCL2P10415 239 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 TPPP3Q9BW30 176 aa14.6□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 SMIM17P0DL12 118 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 RAB4BP61018 213 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 TOR2AQ5JU69 321 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 TM2D2Q9BX73 214 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 VAX2Q9UIW0 290 aa14.59□□□□□ -0.07
NME4-202ENST00000382940 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa14.58□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 RAB19A4D1S5 217 aa14.58□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 F5H697 171 aa14.58□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 KCNIP4Q6PIL6 250 aa14.58□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 SREK1IP1Q8N9Q2 155 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 OR2D3Q8NGH3 330 aa14.58□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 SMIM12Q96EX1 92 aa14.58□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 XKRY2A2RUG3 117 aa14.57□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 RPS20P60866 119 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 Q8N3U1 123 aa14.57□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 C9orf62Q8N4C0 152 aa14.57□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 AP1S3Q96PC3 154 aa14.57□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 BIN3Q9NQY0 253 aa14.57□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa14.56□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 P01737 135 aa14.56□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 DAZ4Q86SG3 579 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 DAZ3Q9NR90 486 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 A0A087WX48 190 aa14.55□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 IGLV2-8P01709 118 aa14.55□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 UBE2D3P61077 147 aa14.55□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 UBE2D2P62837 147 aa14.55□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa14.55□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 GZMBP10144 247 aa14.54□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 OR10G8Q8NGN5 311 aa14.54□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 NIT1Q86X76 327 aa14.53□□□□□ -0.08
NME4-202ENST00000382940 IGLV5-52A0A0A0MRZ9 124 aa14.52□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 C19orf71A6NCJ1 209 aa14.52□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 LRCOL1A6NCL2 159 aa14.52□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 RBFOX3A6NFN3 312 aa14.52□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 ALKAL2Q6UX46 152 aa14.52□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa14.52□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 NTN5Q8WTR8 489 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 RMI2Q96E14 147 aa14.52□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 LRP1BQ9NZR2 4599 aa14.52□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa14.51□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 MGPP08493 103 aa14.51□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 GCSHP23434 173 aa14.51□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 CACNG7P62955 275 aa14.51□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 BLOC1S1P78537 153 aa14.51□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 ELOBQ15370 118 aa14.51□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 Q8N1X5 172 aa14.51□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 Q8N814 137 aa14.51□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 COX11Q9Y6N1 276 aa14.51□□□□□ -0.09
NME4-202ENST00000382940 RYR1P21817 5038 aa14.5□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 88 ms