RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000317201.6

HOXA3-201, Transcript of homeobox A3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene HOXA3, Length 2,761 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3-201ENST00000317201 TRAV8-4A0A0B4J246 113 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 FAM223BA6NKX1 122 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF56Q15929 161 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 TAL2Q16559 108 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 FAM223AQ8IWN6 122 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 PTPN13Q12923 2485 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 APCP25054 2843 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 RBAKDNA6NC62 111 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF491Q8N8L2 437 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF492Q9P255 531 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 CENPEQ02224 2701 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 LY6EQ16553 131 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 BAALCQ8WXS3 180 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 FXYD5Q96DB9 178 aa11.22□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 G3V318 75 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 IGHG4P01861 327 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 LYZP61626 148 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 C15orf32Q32M92 178 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 Q6YL49 198 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 RNF125Q96EQ8 232 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 SLC25A39Q9BZJ4 359 aaPredicted RBP11.21□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 GFRA4Q9GZZ7 299 aa11.21□□□□□ -0.61
HOXA3-201ENST00000317201 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa11.21□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa11.21□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 CTSGP08311 255 aa11.21□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 UBE2D3P61077 147 aa11.21□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 UBE2D2P62837 147 aa11.21□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 CT83Q5H943 113 aa11.21□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 HIST2H2BCQ6DN03 193 aa11.21□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 ORMDL3Q8N138 153 aa11.21□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 EEF1AKMT3Q96AZ1 226 aa11.21□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 GAS8-AS1O95177 125 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 SHANK2-AS3Q9BTD1 123 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 ZMAT4Q9H898 229 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 H3BRN7 92 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 H7C2G1 150 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 GP9P14770 177 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 CKS2P33552 79 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 NAV2Q8IVL1 2488 aa11.2□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP11.19□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 WFDC11Q8NEX6 87 aa11.19□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 ABCA1O95477 2261 aa11.19□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 TRGV11A0A075B6L2 103 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 IGHV4-59P01825 116 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 TWIST1Q15672 202 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 USMG5Q96IX5 58 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 EDN2P20800 178 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 MYCNOSP40205 109 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 SBSPONQ8IVN8 264 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 CSMD2Q7Z408 3487 aa11.18□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 LINC00477Q96M19 166 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 F8WDY8 70 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 BLCAPP62952 87 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 CFHR3Q02985 330 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 S4R3C0 116 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 POLQO75417 2590 aa11.17□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM89A2RUT3 159 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 IGLV1-40P01703 118 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 PMVKQ15126 192 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 SCGB1D4Q6XE38 83 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 CCDC140Q96MF4 163 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 FAM104BQ5XKR9 115 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 GOLT1AQ6ZVE7 132 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 PLEKHB2Q96CS7 222 aa11.16□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 ABCA12Q86UK0 2595 aa11.15□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 TCRAP04437 139 aa11.15□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 LYZL1Q6UWQ5 148 aa11.15□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 C3orf22Q8N5N4 141 aa11.15□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 TMEM86BQ8N661 226 aa11.15□□□□□ -0.62
HOXA3-201ENST00000317201 ZNF785A8K8V0 405 aa11.15□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 IGHV3-23P01764 117 aa11.15□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 TRGV3P03979 118 aa11.15□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 LYPD1Q8N2G4 141 aa11.15□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP11.14□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 LYRM7Q5U5X0 104 aa11.14□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 FMC1Q96HJ9 113 aa11.14□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.14□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 PDE6HQ13956 83 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 Q86TA4 180 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 DUX3Q96PT4 197 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 OTORQ9NRC9 128 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 UBE2D1P51668 147 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 CLEC19AQ6UXS0 136 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 NDUFA11Q86Y39 141 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 Q9H3A6 140 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 SVEP1Q4LDE5 3571 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 PDZD2O15018 2839 aa11.13□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 LINC00527Q9UJ94 153 aa11.12□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 TRBV19A0A075B6N1 114 aa11.12□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa11.12□□□□□ -0.63
HOXA3-201ENST00000317201 GAGE2AQ6NT46 116 aa11.12□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 71.1 ms