RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264350.7

HERC5-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 5, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC5, Length 3,513 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC5-201ENST00000264350 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC5-201ENST00000264350 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP10.28□□□□□ -0.76
HERC5-201ENST00000264350 OR11H12B2RN74 326 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC5-201ENST00000264350 OR11H1Q8NG94 326 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC5-201ENST00000264350 OR11H2Q8NH07 326 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC5-201ENST00000264350 TRBV7-3A0A075B6L6 115 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC5-201ENST00000264350 CD7P09564 240 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC5-201ENST00000264350 SUMO2P61956 95 aaKnown RBP10.28□□□□□ -0.76
HERC5-201ENST00000264350 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC5-201ENST00000264350 NFE4Q86UQ8 179 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC5-201ENST00000264350 PLEKHB2Q96CS7 222 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC5-201ENST00000264350 SMIM2Q9BVW6 85 aa10.28□□□□□ -0.76
HERC5-201ENST00000264350 MUC4Q99102 2169 aa10.27□□□□□ -0.76
HERC5-201ENST00000264350 DEFB136Q30KP8 78 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 FAM159AQ6UWV7 190 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 ZFP2Q6ZN57 461 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 LINC00477Q96M19 166 aa10.27□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP10.27□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 SYNJ2BPP57105 145 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP10.26□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 FAM223BA6NKX1 122 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 C2orf66Q6UXQ4 117 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 FAM223AQ8IWN6 122 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 DPH3P1Q9H4G8 78 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 MXRA5Q9NR99 2828 aa10.26□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 HLA-DRB4P13762 266 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 A0A087WX48 190 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 A0A1W2PRX2 142 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 OVOL1O14753 267 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 RRN3P1Q2M238 152 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa10.25□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 GAGE13Q4V321 117 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 PSMG4Q5JS54 123 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 F8W1H4 67 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 SPOCK3Q9BQ16 436 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 A0A1B0GWB2 263 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 NDUFA4O00483 81 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 RASL10AQ92737 203 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 SPATA25Q9BR10 227 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 SMPXQ9UHP9 88 aa10.24□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 H7C1H1 209 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 LGALS1P09382 135 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 ORMDL2Q53FV1 153 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 ZNF56Q15929 161 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 TMEM170BQ5T4T1 132 aa10.23□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 NDUFS8O00217 210 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 GPHB5Q86YW7 130 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 LINC01356Q8N9X3 169 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 Q96MF0 132 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 ATP6V0BQ99437 205 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 CDIP1Q9H305 208 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 DAZ1Q9NQZ3 744 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 KLK9Q9UKQ9 250 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 ZNF815PA8K554 130 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 F8VRH5 84 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 HOXA3O43365 443 aaPredicted RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP10.22□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 APOMO95445 188 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 MRAP2Q96G30 205 aa10.22□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa10.21□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 LINC01549A6NIU2 74 aa10.21□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 MT-ATP8P03928 68 aa10.21□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 ARL17AQ8IVW1 177 aa10.21□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP10.21□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 ITPR2Q14571 2701 aa10.21□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 IGHV3-64A0A075B6Q5 118 aa10.21□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 GATA3P23771 443 aa10.21□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 PLNP26678 52 aa10.21□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 RPL39P62891 51 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 SYT8Q8NBV8 401 aa10.21□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP10.21□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 U3KQE9 123 aa10.21□□□□□ -0.77
HERC5-201ENST00000264350 TRAV26-1A0A087WT03 109 aa10.21□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10.21□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 A6NDX4 124 aa10.21□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 IGHG2P01859 326 aa10.21□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 SLC25A16P16260 332 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 PRADC1Q9BSG0 188 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 ID1P41134 155 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 SPINK13Q1W4C9 94 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 CKS1BP61024 79 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 USMG5Q96IX5 58 aa10.2□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 AKAP9Q99996 3911 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 KIR2DL4Q99706 377 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 PSMB2P49721 201 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 BAALCQ8WXS3 180 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 CARD19Q96LW7 228 aa10.19□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 TSPAN13O95857 204 aa10.18□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 XGP55808 180 aa10.18□□□□□ -0.78
HERC5-201ENST00000264350 CFAP126Q5VTH2 177 aa10.18□□□□□ -0.78
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