RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000641340.1

MFSD8-223, Transcript of major facilitator superfamily domain containing 8, human

Gene MFSD8, Length 2,098 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MFSD8-223	ENST00000641340	FABP2	P12104	132 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	FABP4	P15090	132 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	COX7A1	P24310	79 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	FOXI2	Q6ZQN5	318 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	NFE4	Q86UQ8	179 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	TOMM6	Q96B49	74 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	CIB3	Q96Q77	187 aa	Predicted RBP	5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	HIST1H2BL	Q99880	126 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	SND1-IT1	Q9HBX3	110 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	FUT9	Q9Y231	359 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	ABCA2	Q9BZC7	2435 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	MALRD1	Q5VYJ5	2156 aa		5.08	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	TMEM30CP	A0ZSE6	113 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	TRGC1	P0CF51	173 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	COL8A2	P25067	703 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	CRYBB3	P26998	211 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	ADAMTSL4-AS1	Q5T5F5	129 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM53A	Q6NSI3	398 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	CEMP1	Q6PRD7	247 aa	Predicted RBP	5.07	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	LINC00305	Q7Z4B0	112 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	KRTAP4-2	Q9BYR5	136 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	WNK2	Q9Y3S1	2297 aa		5.07	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	TRBV7-6	A0A0J9YX20	115 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	IGLL5	B9A064	214 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	UBE2L6	O14933	153 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF705D	P0CH99	300 aa	Predicted RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	PSMB8	P28062	276 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	RRN3P1	Q2M238	152 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	LCA10	Q71F78	164 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	GPHB5	Q86YW7	130 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	DPH3	Q96FX2	82 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	TIMM17A	Q99595	171 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	PLEKHF2	Q9H8W4	249 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	SLC25A22	Q9H936	323 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	MED13L	Q71F56	2210 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	IGHV4-30-2	A0A087WSY4	118 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	PRAC2	D3DTV9	90 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	KRAS	P01116	189 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	FXYD4	P59646	89 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	COA6	Q5JTJ3	125 aa	Known RBP	5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	C9orf66	Q5T8R8	295 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	SLC25A34	Q6PIV7	304 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	TTC9C	Q8N5M4	171 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	MIEN1	Q9BRT3	115 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	POLQ	O75417	2590 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		5.06	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	PTPN13	Q12923	2485 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	PPY	P01298	95 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	LTA	P01374	205 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	PRH1	P02810	166 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	ORMDL2	Q53FV1	153 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	TVP23C	Q96ET8	276 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	TMEM242	Q9NWH2	141 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	APC	P25054	2843 aa		5.05	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	PEX7	O00628	323 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	TCRA	P04437	139 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	HSPB1	P04792	205 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	OR5AC1	P0C628	307 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	PLA2G2A	P14555	144 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	EDDM3B	P56851	147 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	CCL20	P78556	96 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	IGFL4	Q6B9Z1	124 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	LINC00311	Q8N616	119 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	TMEM158	Q8WZ71	300 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	DHRS4-AS1	Q9P1J3	65 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	DPM3	Q9P2X0	92 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	TRBV24-1	A0A075B6N3	115 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	IGHV3-43	A0A0B4J1X8	118 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340		A8MWV9	139 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340		H3BMG7	143 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	PRR4	Q16378	134 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM213B	Q8TBF2	198 aa		5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	MRPL32	Q9BYC8	188 aa	Known RBP	5.04	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	IGLV4-3	A0A075B6K6	122 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	CRYM-AS1	A6NIL9	109 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	CGB3	P0DN86	165 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	CGB7	P0DN87	165 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF818P	Q6ZRF7	136 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340		Q9H3A6	140 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	FKBP11	Q9NYL4	201 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	MRPS16	Q9Y3D3	137 aa	Known RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	TET2	Q6N021	2002 aa	Predicted RBP	5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	IGLV2-14	P01704	120 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	FAM104A	Q969W3	186 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	RPRM	Q9NS64	109 aa		5.03	□□□□□ -1.6
MFSD8-223	ENST00000641340	ZNF586	Q9NXT0	402 aa		5.03	□□□□□ -1.6

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 56.6 ms