RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 CLVS1Q8IUQ0 354 aaPredicted RBP5.41□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 CIRBP-AS1Q8TBR5 109 aa5.41□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM37Q8WXS4 190 aa5.41□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 AP3S1Q92572 193 aa5.41□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 RABL2BQ9UNT1 228 aa5.41□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 STRAPQ9Y3F4 350 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 LPAP08519 4548 aa5.41□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 MUC2Q02817 5179 aa5.4□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 LOC100131303A0A0U1RQF7 123 aa5.4□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMCO3A2RU48 225 aa5.4□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 C9JCJ5 164 aa5.4□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 MPDU1O75352 247 aa5.4□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 NMBP08949 121 aa5.4□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM14EPQ6UXP3 125 aa5.4□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 S100A7AQ86SG5 101 aa5.4□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 TXNDC17Q9BRA2 123 aa5.4□□□□□ -1.54
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa5.39□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRGV4A0A0C4DH28 118 aa5.39□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 GUK1Q16774 197 aa5.39□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00518Q8N0U6 118 aa5.39□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR10P1Q8NGE3 313 aa5.39□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 BLNKQ8WV28 456 aa5.39□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 MGST2Q99735 147 aa5.39□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa5.39□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa5.39□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRBV19A0A075B6N1 114 aa5.38□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 LECT2O14960 151 aa5.38□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 AGPAT2O15120 278 aa5.38□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 RRAS2P62070 204 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP5.38□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 ERCC8Q13216 396 aa5.38□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 CNPY1Q3B7I2 92 aa5.38□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 TDRG1Q3Y452 100 aa5.38□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM128Q5BJH2 165 aa5.38□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 SCGB3A2Q96PL1 93 aa5.38□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 NAA50Q9GZZ1 169 aaKnown RBP5.38□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 NPVFQ9HCQ7 196 aa5.38□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 A0A087WXM4 84 aa5.37□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAV4A0A0B4J268 109 aa5.37□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM168BA1KXE4 195 aa5.37□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 SSSCA1O60232 199 aa5.37□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 COX7A2P2O60397 106 aa5.37□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPP1R1AQ13522 171 aa5.37□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDE6HQ13956 83 aa5.37□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00477Q96M19 166 aa5.37□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 MRPS26Q9BYN8 205 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC25A31Q9H0C2 315 aa5.37□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 VCX3AQ9NNX9 186 aa5.37□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 SFT2D2O95562 160 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPX1P07203 203 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 METTL15P1P0C7V9 234 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 LINC00694P0DN24 101 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 PPT1P50897 306 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 RPL37AP61513 92 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 LELP1Q5T871 98 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 C10orf113Q5VZT2 155 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 GTSF1Q8WW33 167 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 SRRQ9GZT4 340 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 MCUBQ9NWR8 336 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC59Q9P031 241 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM14CQ9P0S9 112 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF492Q9P255 531 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRELID1Q9Y255 219 aa5.36□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 GOSR2O14653 212 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 TSC22D2O75157 780 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGHV3-30P01768 117 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGHV3-33P01772 117 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGHV3-30-3P0DP02 117 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 ACOT6Q3I5F7 207 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q8TAT8 98 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 SMIM8Q96KF7 97 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 GGACTQ9BVM4 153 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 PSENENQ9NZ42 101 aa5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 RABL2AQ9UBK7 228 aaPredicted RBP5.35□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa5.34□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 ASIPP42127 132 aa5.34□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 IL18Q14116 193 aa5.34□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF266Q14584 549 aa5.34□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 OR10J3Q5JRS4 329 aa5.34□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 Q6AWC8 147 aa5.34□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 EXOC3-AS1Q8N2X6 119 aa5.34□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 SPXQ9BT56 116 aa5.34□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa5.34□□□□□ -1.55
USP3-AS1-204ENST00000559861 TRAV8-3A0A0A6YYJ7 113 aa5.33□□□□□ -1.56
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNF222A6NCQ9 220 aa5.33□□□□□ -1.56
USP3-AS1-204ENST00000559861 RGS5O15539 181 aa5.33□□□□□ -1.56
USP3-AS1-204ENST00000559861 PYYP10082 97 aa5.33□□□□□ -1.56
USP3-AS1-204ENST00000559861 TAS2R30P59541 319 aa5.33□□□□□ -1.56
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM183BQ1AE95 376 aa5.33□□□□□ -1.56
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM78Q5T7P6 136 aa5.33□□□□□ -1.56
USP3-AS1-204ENST00000559861 MIC13Q5XKP0 118 aa5.33□□□□□ -1.56
USP3-AS1-204ENST00000559861 TMEM183AQ8IXX5 376 aa5.33□□□□□ -1.56
USP3-AS1-204ENST00000559861 SLC25A29Q8N8R3 303 aa5.33□□□□□ -1.56
USP3-AS1-204ENST00000559861 RAB2BQ8WUD1 216 aa5.33□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.1 ms