RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491292.5

ERCC3-208, Transcript of ERCC excision repair 3, TFIIH core complex helicase subunit, human

TSL 2

Gene ERCC3, Length 4,018 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ERCC3-208	ENST00000491292	TSPAN13	O95857	204 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	ANKRD29	Q8N6D5	301 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	SON	P18583	2426 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	IGLV11-55	A0A075B6I3	123 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	SLC25A20	O43772	301 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	CRYGB	P07316	175 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	7.57	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	ATM	Q13315	3056 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		7.57	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAV21	A0A0B4J279	112 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	CCL21	O00585	134 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	TCL1B	O95988	128 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF688	P0C7X2	276 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	GATA3	P23771	443 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	JPT2	Q9H910	190 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	RPL13A	P40429	203 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	SPX	Q9BT56	116 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	C11orf86	A6NJI1	115 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC01548	A6NM66	108 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	LINC01559	Q495D7	138 aa		7.56	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	RNASE13	Q5GAN3	156 aa	Known RBP	7.56	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	7.56	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292		Q6ZS92	163 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	PHLDA1	Q8WV24	401 aa	Predicted RBP	7.55	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	BAALC	Q8WXS3	180 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	RNF5	Q99942	180 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAV8-4	A0A0B4J246	113 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	SHISA9	B4DS77	424 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM262	E9PQX1	116 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	SPATA25	Q9BR10	227 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	TMEM95	Q3KNT9	176 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	TEN1	Q86WV5	123 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	NFE4	Q86UQ8	179 aa		7.55	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	BUB3	O43684	328 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	HOXB4	P17483	251 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	PAX8	Q06710	450 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	C8orf31	Q8N9H6	132 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292		A4D1N5	150 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	MRPS12	O15235	138 aa	Known RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	PIEZO1	Q92508	2521 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	COX6C	P09669	75 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	MORN3	Q6PF18	240 aa	Predicted RBP	7.54	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	TLN2	Q9Y4G6	2542 aa		7.54	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	7.53	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	MUC3A	Q02505	3323 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	TRBV7-3	A0A075B6L6	115 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	C2orf82	Q6UX34	121 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	VCX2	Q9H322	139 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	IGHV7-81	A0A0B4J1V7	117 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	SDHAF1	A6NFY7	115 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292		J3QQQ9	107 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292		Q6ZS46	218 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	GAGE5	Q13069	117 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	GAGE6	Q13070	117 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	DGAT2L7P	Q6IED9	249 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	GATD1	Q8NB37	220 aa		7.53	□□□□□ -1.2
ERCC3-208	ENST00000491292	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	BRD3OS	Q6XYD6	125 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	NRAC	Q8N912	160 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF625	Q96I27	306 aa	Predicted RBP	7.52	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAV12-2	A0A075B6T6	113 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	PMVK	Q15126	192 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	NDUFA11	Q86Y39	141 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	RASL10A	Q92737	203 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	CACNA1A	O00555	2505 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	TCTEX1D4	Q5JR98	221 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	IGFL2	Q6UWQ7	119 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		7.52	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	ZNF876P	Q49A33	203 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	ACACB	O00763	2458 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	PAPPA-AS1	Q5QFB9	102 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	ZMAT4	Q9H898	229 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	SAA4	P35542	130 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	PRR9	Q5T870	116 aa		7.51	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	MUSTN1	Q8IVN3	82 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	KNCN	A6PVL3	124 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	VCY	O14598	125 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	PLA2G2C	Q5R387	149 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	TOMM6	Q96B49	74 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	KLK9	Q9UKQ9	250 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	RBAKDN	A6NC62	111 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	CFC1B	P0CG36	223 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	CFC1	P0CG37	223 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	SMCP	P49901	116 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	CRIP2	P52943	208 aa	Predicted RBP	7.5	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		7.5	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	GAGE12J	A6NER3	117 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	GAGE7	O76087	117 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	GAGE12F	P0CL80	117 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	GAGE12G	P0CL81	117 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	GAGE12I	P0CL82	117 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	CD28	P10747	220 aa		7.49	□□□□□ -1.21
ERCC3-208	ENST00000491292	GAGE4	Q13068	117 aa		7.49	□□□□□ -1.21

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