RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468045.5

PREB-208, Transcript of prolactin regulatory element binding, human

TSL 2

Gene PREB, Length 3,057 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PREB-208	ENST00000468045	CFC1B	P0CG36	223 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	CFC1	P0CG37	223 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	TSPEAR-AS2	P59090	65 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	IGFL3	Q6UXB1	125 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045		H7C2G1	150 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	PRTN3	P24158	256 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	RAX2	Q96IS3	184 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	SLC50A1	Q9BRV3	221 aa		13.56	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045		A0A0J9YY99	117 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	RBAKDN	A6NC62	111 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045		G3V318	75 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	BRI3	O95415	125 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	ARL3	P36405	182 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	OR11H6	Q8NGC7	330 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	C20orf173	Q96LM9	149 aa		13.55	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	CCDC179	H3BU77	68 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	TRPT1	Q86TN4	253 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	ANKHD1	Q8IWZ3	2542 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045		A8MWV9	139 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	TSHB	P01222	138 aa		13.54	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	RPL39	P62891	51 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	ZNF688	P0C7X2	276 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	RPL32	P62910	135 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	ZFAND6	Q6FIF0	208 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	TEX29	Q8N6K0	151 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	IGHV4-4	A0A075B6R2	117 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045		B9A039	149 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	CCDC140	Q96MF4	163 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	GNRH2	O43555	120 aa		13.53	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	PRR30	Q53SZ7	412 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	IGLV4-69	A0A075B6H9	119 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	NHLRC4	P0CG21	123 aa	Predicted RBP	13.52	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	C3orf56	Q8N813	242 aa		13.52	□□□□□ -0.24
PREB-208	ENST00000468045	SCGB2A1	O75556	95 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	C16orf92	Q96LL3	132 aa		13.52	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	GRN	P28799	593 aa	Known RBP	13.51	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	TMEM170B	Q5T4T1	132 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	VMO1	Q7Z5L0	202 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	ODF3B	A8MYP8	253 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	CD3E	P07766	207 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	AJUBA	Q96IF1	538 aa		13.51	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	IGKV3-7	A0A075B6H7	116 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	ATP6V0E1	O15342	81 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	IGHV3-30	P01768	117 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	C9orf47	Q6ZRZ4	202 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	JPT2	Q9H910	190 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	TP53TG1	Q9Y2A0	90 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	AKAP6	Q13023	2319 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045		C9JAW5	83 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	MUC4	Q99102	2169 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045		F6UB75	175 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045		Q8N9W7	124 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	LINC00527	Q9UJ94	153 aa		13.5	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	IGHV3-64	A0A075B6Q5	118 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	EIF4EBP3	O60516	100 aa	Predicted RBP	13.49	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	CRLF1	O75462	422 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045		Q8N6K4	173 aa		13.49	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	ELANE	P08246	267 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	RNASE4	P34096	147 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	PIP4P1	Q86T03	277 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	GPHB5	Q86YW7	130 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	C10orf126	Q8N4M7	172 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	TLN1	Q9Y490	2541 aa	Known RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	ZNRF2	Q8NHG8	242 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	METTL26	Q96S19	204 aa		13.48	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	OPRPN	Q99935	248 aa	Predicted RBP	13.48	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	SLC25A20	O43772	301 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	ZFAND2A	Q8N6M9	145 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	FAM110A	Q9BQ89	295 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	PRO1854	Q9UHT4	67 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	SPTA1	P02549	2419 aa		13.47	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		13.46	□□□□□ -0.25
PREB-208	ENST00000468045		A4D1N5	150 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	ASIP	P42127	132 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	BEX4	Q9NWD9	120 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045		A0A087WWL8	130 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	C1orf122	Q6ZSJ8	110 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	SLC25A29	Q8N8R3	303 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	COL12A1	Q99715	3063 aa		13.45	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	FAM110D	Q8TAY7	271 aa	Predicted RBP	13.45	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	LYRM7	Q5U5X0	104 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	CITED1	Q99966	193 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	GAGE12J	A6NER3	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	IGIP	A6NJ69	53 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	GAGE7	O76087	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	GAGE12F	P0CL80	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	GAGE12G	P0CL81	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	GAGE12I	P0CL82	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	ID1	P41134	155 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	GAGE4	Q13068	117 aa		13.44	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	NTN5	Q8WTR8	489 aa	Predicted RBP	13.44	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	TRAV2	A0A0B4J234	112 aa		13.43	□□□□□ -0.26
PREB-208	ENST00000468045	IGHV4-39	P01824	125 aa		13.43	□□□□□ -0.26

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