RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455953.1

NCBP2-208, Transcript of nuclear cap binding protein subunit 2, human

TSL 5

Gene NCBP2, Length 548 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
NCBP2-208	ENST00000455953	H2BFS	P57053	126 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCBP2-208	ENST00000455953	SMUG1	Q53HV7	270 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCBP2-208	ENST00000455953	SAPCD1	Q5SSQ6	148 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCBP2-208	ENST00000455953	SREK1IP1	Q8N9Q2	155 aa	Predicted RBP	4.91	□□□□□ -1.62
NCBP2-208	ENST00000455953	C5orf17	Q8NAS9	161 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCBP2-208	ENST00000455953	HSD17B11	Q8NBQ5	300 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCBP2-208	ENST00000455953	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCBP2-208	ENST00000455953	URGCP-MRPS24	S4R325	110 aa		4.91	□□□□□ -1.62
NCBP2-208	ENST00000455953	DNAH10	Q8IVF4	4471 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NCBP2-208	ENST00000455953	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		4.9	□□□□□ -1.62
NCBP2-208	ENST00000455953		H0YIZ8	118 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	HMGB3	O15347	200 aa	Known RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	GCG	P01275	180 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	RAB2A	P61019	212 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	SERF2	P84101	59 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	RHOH	Q15669	191 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF876P	Q49A33	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	AKR1C8P	Q5T2L2	129 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	PRR9	Q5T870	116 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	LYPD5	Q6UWN5	251 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	PRNT	Q86SH4	94 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	CYB561D1	Q8N8Q1	229 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	STOML3	Q8TAV4	291 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	RASL10A	Q92737	203 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	PSMG3	Q9BT73	122 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	NKX6-2	Q9C056	277 aa	Predicted RBP	4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		4.9	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	FXYD6-FXYD2	A0A087WZ82	144 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	PTTG1	O95997	202 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	SEC11B	P0C7V7	166 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	MGST1	P10620	155 aa	Known RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	GCHFR	P30047	84 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	UBE2G1	P62253	170 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	FLI1	Q01543	452 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	TDRG1	Q3Y452	100 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	LGALSL	Q3ZCW2	172 aa	Predicted RBP	4.89	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	FRZB	Q92765	325 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	ZNF479	Q96JC4	524 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	TM2D2	Q9BX73	214 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	ALG5	Q9Y673	324 aa		4.89	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	IGHV3-38	A0A0C4DH36	116 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953		A8MWV9	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	GNRH2	O43555	120 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	TCRA	P04437	139 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	TYMS	P04818	313 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	STAG3L2	P0CL84	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	STAG3L3	P0CL85	134 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	ASIP	P42127	132 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	GNG5	P63218	68 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	TMEM75	Q8N9X5	138 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	OR2G3	Q8NGZ4	309 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	RMI2	Q96E14	147 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	TNFSF18	Q9UNG2	199 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	PSG8	Q9UQ74	426 aa		4.88	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	IGLV5-52	A0A0A0MRZ9	124 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	IGHV3-73	A0A0B4J1V6	119 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	EPM2A	B3EWF7	344 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	ATP6V0C	P27449	155 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	FGF8	P55075	233 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	SGK494	Q96LW2	274 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	AQP10	Q96PS8	301 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953		Q9HAA7	133 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	EPDR1	Q9UM22	224 aa		4.87	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953		A0A087WWC5	75 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	CTXND1	A0A1B0GTU2	59 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	TRBV6-4	A0A1B0GX49	114 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953		A0A1W2PRE2	83 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953		B4DEV8	164 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	GGTLC3	B5MD39	225 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	RHOD	O00212	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	PFDN1	O60925	122 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	EIF3G	O75821	320 aa	Known RBP eCLIP	4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	GIP	P09681	153 aa	Predicted RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	DNAH10OS	P0CZ25	163 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	TPT1	P13693	172 aa	Known RBP	4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	UBE2G2	P60604	165 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	CST9LP1	Q5W188	147 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953		Q6ZQT7	251 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	OR11H4	Q8NGC9	324 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	ATP6V0E2	Q8NHE4	81 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	HIST1H2BA	Q96A08	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	GTSF1L	Q9H1H1	148 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	PHLDA3	Q9Y5J5	127 aa		4.86	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	KIAA1109	Q2LD37	5005 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	TRAV8-3	A0A0A6YYJ7	113 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	TEX46	H3BTG2	121 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	PEX7	O00628	323 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	IGHV3-30	P01768	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	IGHV3-33	P01772	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	IGHV3-30-3	P0DP02	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	IGHV3-30-5	P0DP03	117 aa		4.85	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	GATA1	P15976	413 aa	Predicted RBP	4.85	□□□□□ -1.63
NCBP2-208	ENST00000455953	TIRAP	P58753	221 aa		4.85	□□□□□ -1.63

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