RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000438888.5

PRAME-208, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 4

Gene PRAME, Length 566 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-208ENST00000438888 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa8.89□□□□□ -0.99
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PRAME-208ENST00000438888 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.82□□□□□ -1
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PRAME-208ENST00000438888 SMCO4Q9NRQ5 59 aa8.82□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 SNURFLB1AK76 121 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 RTL8CO15255 209 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 SCO1O75880 301 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 HTN3P15516 51 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 TMEM88Q6PEY1 159 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 CBLN2Q8IUK8 224 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 BORCS7Q96B45 105 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 SPXQ9BT56 116 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa8.81□□□□□ -1
PRAME-208ENST00000438888 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa8.81□□□□□ -1
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