RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434978.6

STXBP4-204, Transcript of syntaxin binding protein 4, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene STXBP4, Length 2,807 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
STXBP4-204	ENST00000434978	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		3.4	□□□□□ -1.86
STXBP4-204	ENST00000434978	LINC00473	A8K010	186 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978		M0R1W7	72 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	GYPB	P06028	91 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	CD7	P09564	240 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	FXYD6P3	P58550	94 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	NPC2	P61916	151 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	ERCC8	Q13216	396 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	TMEM187	Q14656	261 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	RSPO1	Q2MKA7	263 aa	Predicted RBP	3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	ABCA11P	Q4W5N1	156 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	PIK3CD-AS1	Q5SR53	167 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	NFE4	Q86UQ8	179 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	TEN1	Q86WV5	123 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	NEXN-AS1	Q8NBZ9	246 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	COPS9	Q8WXC6	57 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	TMEM230	Q96A57	120 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		3.4	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	TRBV6-7	A0A0A0MS04	114 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	NDUFC2-KCTD14	E9PQ53	114 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	JTB	O76095	146 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	SRP19	P09132	144 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	HLA-DRB4	P13762	266 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	CAV3	P56539	151 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	HOXA4	Q00056	320 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978		Q75L30	129 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	LRRC29	Q8WV35	223 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	SMIM4	Q8WVI0	70 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978		Q96M85	177 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	WWC2-AS2	Q96NR7	200 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	FAM103A1	Q9BTL3	118 aa	Known RBP	3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	GABARAPL1	Q9H0R8	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	RNF114	Q9Y508	228 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	HLA-DRB4	X5D2U9	266 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	DYSF	O75923	2080 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	IGHV1-69D	A0A0B4J2H0	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	TMEM272	A0A1B0GTI8	110 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	ZNF324	O75467	553 aa	Predicted RBP	3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	TCL1B	O95988	128 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	IGHV1-69	P01742	117 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	HLA-DMB	P28068	263 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	UBE2G1	P62253	170 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	QRFP	P83859	136 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	CDK5R1	Q15078	307 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	DCANP1	Q8TF63	244 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	C17orf77	Q96MU5	243 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	DPH3P1	Q9H4G8	78 aa		3.39	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	IGHV1-58	A0A0C4DH39	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	TRBV7-7	A0A0K0K1E9	115 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	CXCL5	P42830	114 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	SNRPD3	P62318	126 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	ZNF816	Q0VGE8	651 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	NSUN5P1	Q3KNT7	163 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	AMN1	Q8IY45	258 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	CEND1	Q8N111	149 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	RPP25L	Q8N5L8	163 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	SCRT2	Q9NQ03	307 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	hADV29S1	A0JD25	119 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	RBMY1B	A6NDE4	496 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	RBMY1E	A6NEQ0	496 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	PRR32	B1ATL7	298 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978		E9PLD3	99 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978		M0R135	149 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	NDUFS5	O43920	106 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	CST7	O76096	145 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	IGKC	P01834	107 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	RBMY1D	P0C7P1	496 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	RBMY1A1	P0DJD3	496 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	PIP	P12273	146 aa	Predicted RBP	3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	DYNLT3	P51808	116 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	PROK1	P58294	105 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	CYCS	P99999	105 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	CLEC19A	Q6UXS0	136 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	FAM19A3	Q7Z5A8	133 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978		Q8N2B8	174 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	ZNRD1	Q9P1U0	126 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	CKLF	Q9UBR5	152 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	LSM2	Q9Y333	95 aa	Known RBP	3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	IGKV1D-8	A0A087WSZ0	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	IGHV4-38-2	P0DP08	117 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	PTHLH	P12272	177 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	CFAP126	Q5VTH2	177 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	LGALS9C	Q6DKI2	356 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	GVQW1	Q8N7I0	195 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	CLEC7A	Q9BXN2	247 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	TP53TG3	Q9ULZ0	132 aa		3.38	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	CMYA5	Q8N3K9	4069 aa		3.37	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	TRAV8-1	A0A0A6YYK1	113 aa		3.37	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	TRAV41	A0A0B4J266	112 aa		3.37	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	MDFIC2	A0A1B0GVS7	189 aa		3.37	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	SNURFL	B1AK76	121 aa		3.37	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	SSSCA1	O60232	199 aa		3.37	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	IGLV3-1	P01715	115 aa		3.37	□□□□□ -1.87
STXBP4-204	ENST00000434978	HLA-DQA1	P01909	254 aa		3.37	□□□□□ -1.87

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65.2 ms