RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409251.7

PTPRN-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,622 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-202ENST00000409251 SNCGO76070 127 aa10.01□□□□□ -0.81
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PTPRN-202ENST00000409251 RPL39LQ96EH5 51 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
PTPRN-202ENST00000409251 FBN2P35556 2912 aa10□□□□□ -0.81
PTPRN-202ENST00000409251 MYMXA0A1B0GTQ4 84 aa10□□□□□ -0.81
PTPRN-202ENST00000409251 TRAV2A0A0B4J234 112 aa10□□□□□ -0.81
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PTPRN-202ENST00000409251 H3BRN7 92 aa10□□□□□ -0.81
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PTPRN-202ENST00000409251 A6NJY4 79 aa9.99□□□□□ -0.81
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PTPRN-202ENST00000409251 GAGE2DQ9UEU5 116 aa9.99□□□□□ -0.81
PTPRN-202ENST00000409251 TEX22C9J3V5 150 aa9.99□□□□□ -0.81
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PTPRN-202ENST00000409251 ZNF493Q6ZR52 646 aa9.97□□□□□ -0.81
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PTPRN-202ENST00000409251 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP9.97□□□□□ -0.81
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PTPRN-202ENST00000409251 PPDPFLQ8WWR9 84 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRN-202ENST00000409251 JMJD1CQ15652 2540 aa9.95□□□□□ -0.82
PTPRN-202ENST00000409251 PLNP26678 52 aa9.95□□□□□ -0.82
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PTPRN-202ENST00000409251 CCDC179H3BU77 68 aa9.94□□□□□ -0.82
PTPRN-202ENST00000409251 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
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PTPRN-202ENST00000409251 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa9.94□□□□□ -0.82
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PTPRN-202ENST00000409251 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRN-202ENST00000409251 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRN-202ENST00000409251 CFAP126Q5VTH2 177 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRN-202ENST00000409251 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRN-202ENST00000409251 NBR2O15453 112 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRN-202ENST00000409251 ZNF688P0C7X2 276 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRN-202ENST00000409251 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRN-202ENST00000409251 Q6ZS46 218 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRN-202ENST00000409251 OR11H6Q8NGC7 330 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRN-202ENST00000409251 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRN-202ENST00000409251 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
PTPRN-202ENST00000409251 OVOL3O00110 214 aa9.93□□□□□ -0.82
PTPRN-202ENST00000409251 LINC00574Q9H8X3 128 aa9.93□□□□□ -0.82
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