RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000400053.8

PTPRM-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRM, Length 5,292 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-202ENST00000400053 G3V318 75 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 SEC61GP60059 68 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 LINC00311Q8N616 119 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP7.01□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 SONP18583 2426 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 IGLC1P0CG04 106 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 C15orf53Q8NAA6 179 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 NACAE9PAV3 2078 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 PRSS47A8MTI9 375 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 CFC1BP0CG36 223 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 CFC1P0CG37 223 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 POU2AF1Q16633 256 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 TTTY13Q9BZ97 58 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 IGLV3-9A0A075B6K5 115 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 K7EM74 188 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 RNF152Q8N8N0 203 aa7□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 WIPF2Q8TF74 440 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF503Q96F45 646 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 KLK9Q9UKQ9 250 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 PLXNB1O43157 2135 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 ATOX1O00244 68 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 CFHR3Q02985 330 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 C4orf48Q5BLP8 95 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 PCDH15Q96QU1 1955 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 EML6Q6ZMW3 1958 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV2D-24A0A075B6R9 120 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 H3BRN7 92 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 SPRY2O43597 315 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 LTAP01374 205 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 IGHG2P01859 326 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 WFDC2Q14508 124 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 DKK4Q9UBT3 224 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 E7EQL1 145 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 IGF2BP2-AS1Q96M15 143 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 PTPN13Q12923 2485 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 RNF223E7ERA6 249 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 C11orf53Q8IXP5 236 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 IGLL5B9A064 214 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 TAX1BP3O14907 124 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 LOXP28300 417 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 WFDC9Q8NEX5 89 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 BUB3O43684 328 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 SP5Q6BEB4 398 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 C8orf31Q8N9H6 132 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 SPATA25Q9BR10 227 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 CR1LQ2VPA4 569 aa6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 IGKV1OR2-108A0A075B7D4 117 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 ZFP2Q6ZN57 461 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 ZNF491Q8N8L2 437 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 FXYD2P54710 66 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 NREPQ16612 68 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 IGFBPL1Q8WX77 278 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 FAM215AQ9Y5M1 114 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 PCNX3Q9H6A9 2034 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 CCL18P55774 89 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 VSIG2Q96IQ7 327 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 TIRAPP58753 221 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 PIP4P1Q86T03 277 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 MSRB1Q9NZV6 116 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRM-202ENST00000400053 SORL1Q92673 2214 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 PDE6GP18545 87 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 CAMK2N2Q96S95 79 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 TM2D2Q9BX73 214 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 SPRY4Q9C004 299 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 TMEM131Q92545 1883 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 A0A0B4J2C4 111 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 PSMB8P28062 276 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 PLA2G5P39877 138 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 Q9H8V8 135 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 TRAV4A0A0B4J268 109 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 RBAKDNA6NC62 111 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 DYNAPQ8N1N2 210 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 RUSC1-AS1Q66K80 236 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 IGFL2Q6UWQ7 119 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 DENND4AQ7Z401 1863 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 K7ERS5 55 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 PROP1O75360 226 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 CXCL5P42830 114 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 XCL1P47992 114 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRM-202ENST00000400053 FOXE3Q13461 319 aa6.94□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 70.3 ms