RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365280.1

RNU6-407P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 407, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-407P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-407P-201ENST00000365280 IQCJQ1A5X6 159 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM78Q5T7P6 136 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 DCUN1D2Q6PH85 259 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 NDUFA11Q86Y39 141 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 DYDC1Q8WWB3 177 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC32Q9BV29 185 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM242Q9NWH2 141 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 NHSL1Q5SYE7 1610 aa-0.6□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 A2MP01023 1474 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 SYNMO15061 1565 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 MAP1LC3B2A6NCE7 125 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 UQCRQO14949 82 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 E2F6O75461 281 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 CFDP00746 253 aaPredicted RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 RPL22P35268 128 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 OTOSQ8NHW6 89 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 CBLN4Q9NTU7 201 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 ROCK1Q13464 1354 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-0.61□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 COX4I1P13073 169 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 SERPINB1P30740 379 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 C3orf33Q6P1S2 294 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 TEX29Q8N6K0 151 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 TAS2R8Q9NYW2 309 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 MED31Q9Y3C7 131 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 C2CD3Q4AC94 2353 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 MUC12Q9UKN1 5478 aa-0.62□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 ZNF292O60281 2723 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 BASP1P80723 227 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLGLB1Q02325 96 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 SSBP1Q04837 148 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 WFDC2Q14508 124 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR8B8Q15620 311 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR2T2Q6IF00 324 aa-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP-0.63□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 KIF13AQ9H1H9 1805 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A087WTM6 91 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A1W2PRE2 83 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 E7EQ34 232 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 AKR1D1P51857 326 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 INSL4Q14641 139 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 Q5VSD8 79 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 Q6ZRX8 168 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 THEM6Q8WUY1 208 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 CNFNQ9BYD5 112 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 ATPIF1Q9UII2 106 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 APC2O95996 2303 aa-0.64□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 CSMD3Q7Z407 3707 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 MED23Q9ULK4 1368 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 DCHS2Q6V1P9 2916 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 VWFP04275 2813 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 A0A0D9SFI3 127 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 HIST1H1BP16401 226 aaKnown RBP-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCL3L1P16619 93 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 CRYBA4P53673 196 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 DEFB109BQ30KR1 87 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 HSD17B12Q53GQ0 312 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 HRCT1Q6UXD1 115 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC25A26Q70HW3 274 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 STX12Q86Y82 276 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 SCP2D1Q9UJQ7 156 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 NDUFAF1Q9Y375 327 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC171Q6TFL3 1326 aa-0.65□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 PHIPQ8WWQ0 1821 aa-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 ARAP1Q96P48 1450 aa-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 TNXBP22105 4242 aa-0.66□□□□□ -2.51
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRBV7-1A0A0A6YYK4 115 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM14DPA8MWL7 114 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC25A5P05141 298 aaKnown RBP-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 SPINK8P0C7L1 97 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 PCBD1P61457 104 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 SLC48A1Q6P1K1 146 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 Q96NJ1 140 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 BATF3Q9NR55 127 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 ERG28Q9UKR5 140 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 CASZ1Q86V15 1759 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa-0.66□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 PLCE1Q9P212 2302 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 TMEM238C9JI98 176 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 CCDC179H3BU77 68 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 M0QZK8 103 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 PRM1P04553 51 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 PSPHP78330 225 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 FAM74A4Q5TZK3 123 aa-0.67□□□□□ -2.52
RNU6-407P-201ENST00000365280 TRIQKQ629K1 86 aa-0.67□□□□□ -2.52
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.7 ms