RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 SORL1Q92673 2214 aa11.98□□□□□ -0.49
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PTPRU-201ENST00000345512 MSRB2Q9Y3D2 182 aa11.98□□□□□ -0.49
PTPRU-201ENST00000345512 IGKV2D-26A0A0A0MRZ7 120 aa11.97□□□□□ -0.49
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PTPRU-201ENST00000345512 G3V4G9 280 aa11.97□□□□□ -0.49
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM141Q96I45 108 aa11.97□□□□□ -0.49
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PTPRU-201ENST00000345512 ATP6V0BQ99437 205 aa11.9□□□□□ -0.51
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PTPRU-201ENST00000345512 MAPKAPK5-AS1Q8N8E1 139 aa11.89□□□□□ -0.51
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PTPRU-201ENST00000345512 E9PLD3 99 aa11.88□□□□□ -0.51
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PTPRU-201ENST00000345512 ZNF415Q09FC8 603 aa11.87□□□□□ -0.51
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PTPRU-201ENST00000345512 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 TM2D2Q9BX73 214 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 ZFAND3Q9H8U3 227 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 MRPS12O15235 138 aaKnown RBP11.87□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 SLC25A20O43772 301 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 VCANP13611 3396 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM95Q3KNT9 176 aa11.87□□□□□ -0.51
PTPRU-201ENST00000345512 C10orf126Q8N4M7 172 aa11.87□□□□□ -0.51
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