RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282841.9

GGPS1-201, Transcript of geranylgeranyl diphosphate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GGPS1, Length 2,895 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGPS1-201ENST00000282841 CCL24O00175 119 aa8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 ARMS2P0C7Q2 107 aa8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 FXYD7P58549 80 aa8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 FAM162BQ5T6X4 162 aa8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM61Q8N0U2 210 aa8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 MTURNQ8N3F0 131 aa8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 TSSC4Q9Y5U2 329 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF138P52744 262 aa8.23□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF575Q86XF7 245 aa8.23□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 TRAV12-2A0A075B6T6 113 aa8.23□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM189A5PLL7 270 aa8.23□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 A8MWL6 223 aa8.23□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 TYMSP04818 313 aa8.23□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM136Q6ZRR5 245 aa8.23□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 OR8A1Q8NGG7 326 aa8.22□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.22□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 ZNF492Q9P255 531 aa8.22□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 GAGE10A6NGK3 116 aa8.22□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 KNCNA6PVL3 124 aa8.22□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 M0R2Z0 102 aa8.22□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 RPL24P83731 157 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 HSD52Q0P140 79 aa8.22□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 RNF183Q96D59 192 aa8.22□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 NDFIP1Q9BT67 221 aa8.22□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 MSRB1Q9NZV6 116 aa8.22□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 NPIPB6E9PJ23 425 aa8.21□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 AMTP48728 403 aa8.21□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 LYZL1Q6UWQ5 148 aa8.21□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 APRG1Q8IVJ8 170 aa8.21□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 SPATA3Q8NHX4 192 aa8.21□□□□□ -1.09
GGPS1-201ENST00000282841 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa8.21□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 CSN3P07498 182 aa8.21□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 CTRLP40313 264 aa8.21□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 PROK1P58294 105 aa8.21□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 KRTDAPP60985 99 aa8.21□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 DYNLRB2Q8TF09 96 aa8.21□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 TMEM160Q9NX00 188 aa8.21□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa8.2□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 GAGE12HA6NDE8 117 aa8.2□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 LGALS9O00182 355 aa8.2□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 PRM2P04554 102 aa8.2□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 RBPMS2Q6ZRY4 209 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa8.2□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 GPX1P07203 203 aa8.2□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 C9orf47Q6ZRZ4 202 aa8.2□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 FABP5P3A8MUU1 101 aa8.2□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 K7EQG2 157 aa8.2□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 DEFB131AP59861 70 aa8.2□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 C5orf47Q569G3 176 aa8.2□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 ZFAND2AQ8N6M9 145 aa8.2□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 C16orf95Q9H693 158 aa8.2□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 SRIP30626 198 aa8.19□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.19□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 CRLF1O75462 422 aa8.19□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 APCSP02743 223 aa8.19□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 HTN1P15515 57 aa8.19□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 GAGE5Q13069 117 aa8.19□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 GAGE6Q13070 117 aa8.19□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 SPINK13Q1W4C9 94 aa8.19□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 PET117Q6UWS5 81 aa8.19□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa8.18□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 RBAKDNA6NC62 111 aa8.18□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 MPV17L2Q567V2 206 aa8.18□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 OVOL1O14753 267 aa8.18□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 GNRH2O43555 120 aa8.18□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 SNRPD3P62318 126 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 DEFB114Q30KQ6 69 aa8.18□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 ATOH7Q8N100 152 aa8.18□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 GNB1LQ9BYB4 327 aa8.18□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 PEMTQ9UBM1 199 aa8.18□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa8.18□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 HBBP68871 147 aa8.17□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.17□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 RCHY1Q96PM5 261 aa8.17□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 SAMD10Q9BYL1 202 aa8.17□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.17□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1B0GXF2 115 aa8.17□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 CRISP2P16562 243 aa8.17□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 NTF3P20783 257 aa8.17□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 TWIST1Q15672 202 aa8.17□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 MRPL53Q96EL3 112 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 WFDC10AQ9H1F0 79 aa8.17□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 HSPB8Q9UJY1 196 aa8.17□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 A0A1B0GUT8 65 aa8.16□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 H3BVH4 76 aa8.16□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 OR10AG1Q8NH19 301 aa8.16□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 LINC00477Q96M19 166 aa8.16□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 JMJD8Q96S16 334 aa8.16□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 TEX48A0A1B0GUV7 120 aa8.16□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 SMKR1H3BMG3 65 aa8.16□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 FHL3Q13643 280 aa8.16□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 CT83Q5H943 113 aa8.16□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 BAGE3Q86Y29 109 aa8.16□□□□□ -1.1
GGPS1-201ENST00000282841 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa8.16□□□□□ -1.1
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