RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000271526.8

PRCC-201, Transcript of proline rich mitotic checkpoint control factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRCC, Length 2,105 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCC-201ENST00000271526 UBE2D3P61077 147 aa13.16□□□□□ -0.3
PRCC-201ENST00000271526 UBE2D2P62837 147 aa13.16□□□□□ -0.3
PRCC-201ENST00000271526 GPHB5Q86YW7 130 aa13.16□□□□□ -0.3
PRCC-201ENST00000271526 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
PRCC-201ENST00000271526 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa13.15□□□□□ -0.3
PRCC-201ENST00000271526 ATP5G2Q06055 141 aa13.15□□□□□ -0.3
PRCC-201ENST00000271526 FOXI1Q12951 378 aa13.15□□□□□ -0.3
PRCC-201ENST00000271526 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP13.15□□□□□ -0.3
PRCC-201ENST00000271526 C5orf56Q8N8D9 126 aa13.15□□□□□ -0.3
PRCC-201ENST00000271526 NPFFO15130 113 aa13.15□□□□□ -0.3
PRCC-201ENST00000271526 NXPH4O95158 308 aa13.15□□□□□ -0.3
PRCC-201ENST00000271526 CD7P09564 240 aa13.15□□□□□ -0.3
PRCC-201ENST00000271526 PLEKHB2Q96CS7 222 aa13.15□□□□□ -0.3
PRCC-201ENST00000271526 CSMD1Q96PZ7 3565 aa13.14□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 LINC01549A6NIU2 74 aa13.14□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 FAM223BA6NKX1 122 aa13.14□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 TSPAN13O95857 204 aa13.14□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 CRYGDP07320 174 aa13.14□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 FAM223AQ8IWN6 122 aa13.14□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa13.14□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 SCGB2A2Q13296 93 aa13.13□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 LCNL1Q6ZST4 164 aa13.13□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 OR10J6PQ8NGY7 276 aa13.13□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 IGLV4-69A0A075B6H9 119 aa13.13□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa13.13□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 S100A4P26447 101 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa13.13□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 PAPPA-AS1Q5QFB9 102 aa13.13□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 BRI3O95415 125 aa13.12□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 SCGB1D4Q6XE38 83 aa13.12□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 BPESC1Q9GZL8 116 aa13.12□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 IGF2RP11717 2491 aa13.12□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 IGHV4OR15-8A0A075B7B6 117 aa13.12□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 A0A087WW49 117 aa13.12□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 MGPP08493 103 aa13.12□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 LYRM7Q5U5X0 104 aa13.12□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 CDIP1Q9H305 208 aa13.12□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 UBTD1Q9HAC8 227 aa13.12□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 WNK2Q9Y3S1 2297 aa13.11□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 TSHBP01222 138 aa13.11□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 KIF25-AS1Q9Y6Z4 181 aa13.11□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 A0A0J9YY99 117 aa13.1□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 IGIPA6NJ69 53 aa13.1□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 C11orf86A6NJI1 115 aa13.1□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 SPRY2O43597 315 aa13.1□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 DUSP14O95147 198 aaKnown RBP13.1□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 LINC00315P59091 139 aa13.1□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 NFE4Q86UQ8 179 aa13.1□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 TRAV41A0A0B4J266 112 aa13.09□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 J3KRW8 73 aa13.09□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 ARL3P36405 182 aa13.09□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 HERVK_113P61574 105 aa13.09□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 NDUFA11Q86Y39 141 aa13.09□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 SBSPONQ8IVN8 264 aa13.09□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 NBASA2RRP1 2371 aa13.09□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 NDUFA4O00483 81 aa13.09□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 MOB4Q9Y3A3 225 aa13.09□□□□□ -0.31
PRCC-201ENST00000271526 ATRXP46100 2492 aa13.08□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 POLR2KP53803 58 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 PMVKQ15126 192 aa13.08□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 UNQ9165/PRO28630Q6UXU0 137 aa13.08□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 SYT8Q8NBV8 401 aa13.08□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa13.08□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 TMEM141Q96I45 108 aa13.08□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 PSMB2P49721 201 aa13.07□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 ZFP2Q6ZN57 461 aa13.07□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 TIMM17AQ99595 171 aa13.07□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 GNRH2O43555 120 aa13.07□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 CKS1BP61024 79 aa13.07□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa13.07□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa13.06□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 IGHV3-30P01768 117 aa13.06□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa13.06□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 RNASE4P34096 147 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 TEN1Q86WV5 123 aa13.06□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 PPDPFLQ8WWR9 84 aa13.06□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa13.06□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 RELNP78509 3460 aa13.06□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 LOC107984156A0A0G2JMH3 177 aa13.06□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 FHL3Q13643 280 aa13.06□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 ARL17AQ8IVW1 177 aa13.06□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 SLC25A29Q8N8R3 303 aa13.06□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 IGHV1-69P01742 117 aa13.05□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 CRYBA4P53673 196 aa13.05□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 AMELXQ99217 191 aa13.05□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 VCX2Q9H322 139 aa13.05□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 MED13LQ71F56 2210 aa13.04□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 IGHV4-39P01824 125 aa13.04□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 DEFB1P60022 68 aa13.04□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 ZNF418Q8TF45 676 aaPredicted RBP13.04□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 CARD19Q96LW7 228 aa13.04□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 PRORYQ9H606 182 aa13.04□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 KLLNB2CW77 178 aa13.04□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 H3BUA1 57 aa13.04□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 TCL1BO95988 128 aa13.04□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 TRBV12-3P01733 135 aa13.04□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 CFC1BP0CG36 223 aa13.04□□□□□ -0.32
PRCC-201ENST00000271526 CFC1P0CG37 223 aa13.04□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.6 ms