RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516525.1

RNU6-1337P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1337, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1337P, Length 95 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MAXP61244 160 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ERVS71-1P61550 626 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 EMX2Q04743 252 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SMIM11BQ8TCY0 68 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BET1LQ9NYM9 111 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 APC2O95996 2303 aa-0.77□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DLC1Q96QB1 1528 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IFNA6P05013 189 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 APODP05090 189 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FABP2P12104 132 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DEFB109BQ30KR1 87 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 UNQ5815/PRO19632Q6UWF5 114 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 UNQ5830/PRO19650/PRO19816Q6UY13 95 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 OR5A2Q8NGI9 324 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 AP3S1Q92572 193 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BORCS8Q96FH0 119 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PRELID3AQ96N28 172 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SMIM7Q9BQ49 75 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 OTORQ9NRC9 128 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 FKBP11Q9NYL4 201 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CHD6Q8TD26 2715 aa-0.78□□□□□ -2.53
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRAV17A0A0B4J275 112 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRBV10-1A0A0K0K1A3 114 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 APOC1P02654 83 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PRM1P04553 51 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CSN2P05814 226 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LRTM1Q9HBL6 345 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP-0.79□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 WFDC2Q14508 124 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CARD19Q96LW7 228 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SS18L2Q9UHA2 77 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SSC5DA1L4H1 1573 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MYH1P12882 1939 aa-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NUP210Q8TEM1 1887 aaPredicted RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP-0.8□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ZNF670-ZNF695F2Z2N8 137 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CTXN2P0C2S0 81 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SDC2P34741 201 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 POLR2JP52435 117 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ARF6P62330 175 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RPL19P84098 196 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LTC4SQ16873 150 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 OR13C6PQ8NH95 151 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DGCR14Q96DF8 476 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GINS3Q9BRX5 216 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PARVGQ9HBI0 331 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMEM242Q9NWH2 141 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NUBP2Q9Y5Y2 271 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DOCK11Q5JSL3 2073 aa-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP-0.81□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LAMB1P07942 1786 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRBV27A0A0K0K1C4 114 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 RBAKDNA6NC62 111 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 M0R3E3 92 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 OR2H2O95918 312 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IFNA21P01568 189 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 S100A6P06703 90 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 SLC25A4P12235 298 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 REEP5Q00765 189 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 DHRS4L2Q6PKH6 230 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MED11Q9P086 117 aa-0.82□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MYH3P11055 1940 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 GABARAPH6UMI1 98 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MFSD11O43934 449 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IFNA1P01562 189 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 COX4I1P13073 169 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ADCYAP1P18509 176 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TAS2R41P59536 307 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LSM3P62310 102 aaKnown RBP-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 BLCAPP62952 87 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMED2Q15363 201 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 Q5VSD8 79 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LINC00305Q7Z4B0 112 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 MORN4Q8NDC4 146 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 OR51A4Q8NGJ6 313 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CEP19Q96LK0 163 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 VPS25Q9BRG1 176 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PRO0255Q9UI72 69 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 ACANP16112 2415 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 LRP5O75197 1615 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TECPR2O15040 1411 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PTPRGP23470 1445 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 WNK1Q9H4A3 2382 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa-0.83□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 IGHV1-24A0A0C4DH33 117 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 TMEM210A6NLX4 147 aa-0.84□□□□□ -2.54
RNU6-1337P-201ENST00000516525 CKS2P33552 79 aa-0.84□□□□□ -2.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms