RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000506510.6

PDE4D-215, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 4

Gene PDE4D, Length 558 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-215ENST00000506510 MYO16Q9Y6X6 1858 aa2.48□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 PTPRBP23467 1997 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 FANCAO15360 1455 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 IQSEC2Q5JU85 1478 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 PRXQ9BXM0 1461 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 NCKAP5O14513 1909 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 MYH13Q9UKX3 1938 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 APOC4-APOC2K7ER74 178 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 ERC2-IT1O76042 136 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 IGLV6-57P01721 117 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 APOC2P02655 101 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 IGFBP7Q16270 282 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 PRR9Q5T870 116 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 SFT2D1Q8WV19 159 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 RICTORQ6R327 1708 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 SHANK1Q9Y566 2161 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 COL1A2P08123 1366 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 EFCAB5A4FU69 1503 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa2.47□□□□□ -2.01
PDE4D-215ENST00000506510 PLXNA3P51805 1871 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 IGKV1D-17A0A075B6S4 117 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 MCRIP1C9JLW8 97 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 J3QLW9 94 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 IGFL1Q6UW32 110 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 C2orf82Q6UX34 121 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 CASC2Q6XLA1 102 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 CLECL1Q8IZS7 167 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 VSTM2AQ8TAG5 236 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 LSM10Q969L4 123 aaKnown RBP2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa2.46□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 SAMD9Q5K651 1589 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 CFAP74Q9C0B2 1584 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 PREX1Q8TCU6 1659 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 ZFHX2Q9C0A1 2572 aaPredicted RBP2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 A0A0G2JQZ4 141 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 A0A1W2PNN7 141 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 C2orf70A6NJV1 201 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 E7EQL1 145 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 IGKV1-17P01599 117 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 SPINK8P0C7L1 97 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 P0C880 135 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 S100A10P60903 97 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 C9orf153Q5TBE3 101 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 OR2T2Q6IF00 324 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 SVBPQ8N300 66 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 Q8TAT8 98 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 TIMM21Q9BVV7 248 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 STRCQ7RTU9 1775 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa2.45□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 MYO9BQ13459 2157 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 SDK2Q58EX2 2172 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 MYH1P12882 1939 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 CXCL8P10145 99 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 IFITM1P13164 125 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 MIR22HGQ0VDD5 57 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 PDE6HQ13956 83 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 Q6AWC8 147 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 FOXI2Q6ZQN5 318 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 Q6ZS92 163 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 SLC25A26Q70HW3 274 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 LINC00526Q96FQ7 95 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 SNHG12Q9BXW3 62 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 HEATR5BQ9P2D3 2071 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 SCN3AQ9NY46 2000 aa2.44□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 AGLP35573 1532 aa2.43□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 CITO14578 2027 aa2.43□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 IL5P05113 134 aa2.43□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 ELOBQ15370 118 aa2.43□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 TPRXLQ17RH7 258 aa2.43□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa2.43□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 C5orf17Q8NAS9 161 aa2.43□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 PLPP5Q8NEB5 264 aa2.43□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 SPTSSAQ969W0 71 aa2.43□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 TMEM242Q9NWH2 141 aa2.43□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 GLI3P10071 1580 aa2.43□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 SCAPERQ9BY12 1400 aa2.42□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 RP1P56715 2156 aa2.42□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 MUC4Q99102 2169 aa2.42□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 MGAMO43451 1857 aa2.42□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa2.42□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 MLH3Q9UHC1 1453 aa2.42□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 OOSP1A8MZH6 123 aa2.42□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 MPC2O95563 127 aa2.42□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 Q1T7F1 81 aa2.42□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa2.42□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 ZNF833PQ6ZTB9 187 aa2.42□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP2.42□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 TTC9CQ8N5M4 171 aa2.42□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 HELZP42694 1942 aaKnown RBP2.42□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa2.41□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 USP54Q70EL1 1684 aa2.41□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 QRICH2Q9H0J4 1663 aa2.41□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 IGKV2-24A0A0C4DH68 120 aa2.41□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 SDHAF1A6NFY7 115 aa2.41□□□□□ -2.02
PDE4D-215ENST00000506510 SNCGO76070 127 aa2.41□□□□□ -2.02
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