RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492741.5

PSPC1-204, Transcript of paraspeckle component 1, humanhuman

TSL 2

Gene PSPC1, Length 1,709 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSPC1-204ENST00000492741 KIR2DL5AQ8N109 375 aa16.1■□□□□ 0.17
PSPC1-204ENST00000492741 KIR2DL5BQ8NHK3 375 aa16.1■□□□□ 0.17
PSPC1-204ENST00000492741 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa16.09■□□□□ 0.17
PSPC1-204ENST00000492741 RPS20P60866 119 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM242Q9NWH2 141 aa16.09■□□□□ 0.17
PSPC1-204ENST00000492741 SCO1O75880 301 aa16.08■□□□□ 0.17
PSPC1-204ENST00000492741 GZMBP10144 247 aa16.08■□□□□ 0.17
PSPC1-204ENST00000492741 KCNS1Q96KK3 526 aa16.08■□□□□ 0.17
PSPC1-204ENST00000492741 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa16.08■□□□□ 0.17
PSPC1-204ENST00000492741 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa16.08■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 GRIFINA4D1Z8 144 aa16.08■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 A8MZ25 164 aa16.08■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 CT83Q5H943 113 aa16.08■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM256Q8N2U0 113 aa16.08■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 C1orf158Q8N1D5 194 aa16.07■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 TSKUQ8WUA8 353 aa16.07■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 PYGO2Q9BRQ0 406 aa16.07■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 IL36BQ9NZH7 164 aa16.07■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 TCL1AP56279 114 aa16.06■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 DEFB121Q5J5C9 76 aa16.06■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM88Q6PEY1 159 aa16.06■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 CBY3A6NI87 242 aa16.05■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 GNRH2O43555 120 aa16.05■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 S100PP25815 95 aa16.05■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 S100A4P26447 101 aaKnown RBP16.05■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 URGCP-MRPS24S4R325 110 aa16.05■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 UBE2CO00762 179 aa16.05■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 FRMD6-AS1P0C7T7 363 aa16.05■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 KCNIP4Q6PIL6 250 aa16.05■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 CSNK1G2-AS1Q8NCQ2 148 aa16.05■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 TPPP3Q9BW30 176 aa16.05■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 SMCO4Q9NRQ5 59 aa16.05■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 K7EIL1 84 aa16.04■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 CBLN2Q8IUK8 224 aa16.04■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 NEU1Q99519 415 aa16.04■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 TP53TG3Q9ULZ0 132 aa16.04■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 MGAM2Q2M2H8 2515 aa16.04■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 CXorf65A6NEN9 183 aa16.03■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 TYMSP04818 313 aa16.03■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 ASIPP42127 132 aa16.03■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 FAM3BP58499 235 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 TDRG1Q3Y452 100 aa16.03■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 SMIM27A0A1W2PRY6 76 aa16.02■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 HIGD1CA8MV81 97 aa16.02■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 DEFB135Q30KP9 77 aa16.02■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 IMMP2LQ96T52 175 aa16.02■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 GFRA4Q9GZZ7 299 aa16.02■□□□□ 0.16
PSPC1-204ENST00000492741 TRGV11A0A075B6L2 103 aa16.02■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 PRM2P04554 102 aa16.02■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 GTSF1Q8WW33 167 aa16.02■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 PGLYRP4Q96LB8 373 aa16.02■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 NAT8BQ9UHF3 227 aa16.02■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF575Q86XF7 245 aa16.01■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa16.01■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 A0A1W2PPQ1 181 aa16■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 FAM231BA6NCW3 169 aa16■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 RCHY1Q96PM5 261 aa16■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 LINC00467Q9BRT7 94 aa16■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 H3BVH4 76 aa15.99■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 CXCL1P09341 107 aa15.99■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 NUP35Q8NFH5 326 aa15.99■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 DNAH3Q8TD57 4116 aa15.99■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 ARMS2P0C7Q2 107 aa15.99■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 SSTP61278 116 aa15.99■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 Q6ZWC4 215 aa15.99■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 NOTCH1P46531 2555 aa15.99■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 DNHD1Q96M86 4753 aa15.98■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 SPINK4O60575 86 aa15.98■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 LYZL1Q6UWQ5 148 aa15.98■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 MDFICQ9P1T7 246 aa15.98■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa15.97■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 AZU1P20160 251 aa15.97■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 RRN3P1Q2M238 152 aa15.97■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 BORCS7Q96B45 105 aa15.97■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 MUC21A0A0G2JKD1 596 aa15.97■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 MUC21A0A140T8X8 626 aa15.97■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 IGLC6P0CF74 106 aa15.97■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 FOXA3P55318 350 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 F2Z2F3 143 aa15.96■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 RNASE3P12724 160 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 ZNF415Q09FC8 603 aa15.96■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 ELOBQ15370 118 aa15.96■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 DNLZQ5SXM8 178 aa15.96■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 BTF3L4Q96K17 158 aa15.96■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 PHLDA3Q9Y5J5 127 aa15.96■□□□□ 0.15
PSPC1-204ENST00000492741 SPRY2O43597 315 aa15.95■□□□□ 0.14
PSPC1-204ENST00000492741 OR11H2Q8NH07 326 aa15.95■□□□□ 0.14
PSPC1-204ENST00000492741 MRAPQ8TCY5 172 aa15.95■□□□□ 0.14
PSPC1-204ENST00000492741 RNF183Q96D59 192 aa15.95■□□□□ 0.14
PSPC1-204ENST00000492741 OR5AL1P0C617 328 aa15.94■□□□□ 0.14
PSPC1-204ENST00000492741 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa15.94■□□□□ 0.14
PSPC1-204ENST00000492741 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa15.94■□□□□ 0.14
PSPC1-204ENST00000492741 SPANXN1Q5VSR9 72 aa15.94■□□□□ 0.14
PSPC1-204ENST00000492741 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PSPC1-204ENST00000492741 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PSPC1-204ENST00000492741 C16orf74Q96GX8 76 aa15.94■□□□□ 0.14
PSPC1-204ENST00000492741 TRAV9-1A0A075B6T8 112 aa15.93■□□□□ 0.14
PSPC1-204ENST00000492741 TGIF2-C20orf24A0A0A6YYL0 155 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.2 ms