RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481079.1

PTPRD-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type D, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD, Length 521 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-210ENST00000481079 A0A1B0GVY2 172 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 PPT1P50897 306 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 TCL1AP56279 114 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 OR5I1Q13606 314 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP16.69■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 TVP23CQ96ET8 276 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 TREM1Q9NP99 234 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 HERC2O95714 4834 aa16.69■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 TEX46H3BTG2 121 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 PEX7O00628 323 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 SPINK4O60575 86 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 IGLV2-11P01706 119 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 CCL20P78556 96 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 ZNRF2Q8NHG8 242 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 HIST1H2BAQ96A08 127 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 LINC00479Q96M42 142 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 ARL2-SNX15V9GYD0 113 aa16.68■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 F6UZH7 168 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 RGS13O14921 159 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 FLI1Q01543 452 aaPredicted RBP16.67■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 ALKAL2Q6UX46 152 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 PRNTQ86SH4 94 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM75Q8N9X5 138 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 NDFIP1Q9BT67 221 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 LINC00588Q9Y4M8 146 aa16.67■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 TRAV34A0A0B4J273 112 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 FBLL1A6NHQ2 334 aaKnown RBP16.66■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 Q6AWC8 147 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 DNAH11Q96DT5 4516 aa16.66■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 TRGV1A0A0A0MS02 117 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 A0A0J9YY99 117 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 TCEAL7Q9BRU2 100 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 GNG13Q9P2W3 67 aa16.65■□□□□ 0.26
PTPRD-210ENST00000481079 H3BNG1 76 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 CCL18P55774 89 aa16.64■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 MUC4Q99102 2169 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 TRGV2A0A075B6R0 118 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 PRSS29PA6NIE9 313 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 VSIG2Q96IQ7 327 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 C8orf49Q96NF6 230 aa16.63■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 KIAA1109Q2LD37 5005 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 MUC21Q5SSG8 566 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 MANBALQ9NQG1 85 aa16.62■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 TRAV21A0A0B4J279 112 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 MRPL16Q9NX20 251 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 MDFICQ9P1T7 246 aa16.61■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 NBDYA0A0U1RRE5 68 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 BLOC1S1P78537 153 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 FAM159AQ6UWV7 190 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 FMC1Q96HJ9 113 aa16.6■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 GCGP01275 180 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 AKR1C3P42330 323 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 UBE2G1P62253 170 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF415Q09FC8 603 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 ESRGQ1W209 222 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 TDRG1Q3Y452 100 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 SMUG1Q53HV7 270 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 NAGKQ9UJ70 344 aa16.59■□□□□ 0.25
PTPRD-210ENST00000481079 ZNF80P51504 273 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 C1orf134Q5TEV5 83 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 Q86TA4 180 aa16.58■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 A0A096LPF7 62 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 SCO2A0A1W2PP80 73 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 IFNA1P01562 189 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM183BQ1AE95 376 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 ZFP30Q9Y2G7 519 aa16.57■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 TMEM183AQ8IXX5 376 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 UPK3BQ9BT76 320 aa16.56■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 TRBV6-1A0A0K0K1D8 114 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 IGHV3-53P01767 116 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 S100A9P06702 114 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 PFN1P07737 140 aaKnown RBP16.55■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 TXNDC17Q9BRA2 123 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 Q9H8V8 135 aa16.55■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 GNRH2O43555 120 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 FHL2Q14192 279 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 SOHLH1Q5JUK2 328 aa16.54■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 TRGV11A0A075B6L2 103 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 LTAP01374 205 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 BCL2P10415 239 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 RASL10AQ92737 203 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 KCNS1Q96KK3 526 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 SPXQ9BT56 116 aa16.53■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 MRPS16Q9Y3D3 137 aaKnown RBP16.53■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 FABP5P3A8MUU1 101 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 TAGLN2P37802 199 aaKnown RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 MEF2BQ02080 365 aaPredicted RBP16.52■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 SDF2L1Q9HCN8 221 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 C11orf21Q9P2W6 132 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 VAX2Q9UIW0 290 aa16.52■□□□□ 0.24
PTPRD-210ENST00000481079 IGHV3-16A0A0C4DH30 117 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 CRYBA4P53673 196 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 COX8CQ7Z4L0 72 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 LYPD6BQ8NI32 183 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 PRO0255Q9UI72 69 aa16.51■□□□□ 0.23
PTPRD-210ENST00000481079 PAX4O43316 350 aa16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.8 ms