RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465902.1

USP19-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 19, human

TSL 3

Gene USP19, Length 617 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
USP19-210	ENST00000465902	ARL2-SNX15	V9GYD0	113 aa		12.54	□□□□□ -0.4
USP19-210	ENST00000465902	ZNF80	P51504	273 aa	Predicted RBP	12.53	□□□□□ -0.4
USP19-210	ENST00000465902	OR5I1	Q13606	314 aa		12.53	□□□□□ -0.4
USP19-210	ENST00000465902	TCEAL7	Q9BRU2	100 aa		12.53	□□□□□ -0.4
USP19-210	ENST00000465902	SDF2L1	Q9HCN8	221 aa		12.53	□□□□□ -0.4
USP19-210	ENST00000465902	MDFIC	Q9P1T7	246 aa		12.53	□□□□□ -0.4
USP19-210	ENST00000465902	GNG13	Q9P2W3	67 aa		12.53	□□□□□ -0.4
USP19-210	ENST00000465902	NACA	E9PAV3	2078 aa		12.53	□□□□□ -0.4
USP19-210	ENST00000465902	GNRH2	O43555	120 aa		12.52	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	AKR1C3	P42330	323 aa		12.52	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	CCL20	P78556	96 aa		12.52	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902		Q86TA4	180 aa		12.52	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	FMC1	Q96HJ9	113 aa		12.52	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	KCNS1	Q96KK3	526 aa		12.52	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	MRPL16	Q9NX20	251 aa	Known RBP	12.52	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	BIRC6	Q9NR09	4857 aa		12.52	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	LINC00612	Q8N6U2	182 aa		12.51	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	MUC4	Q99102	2169 aa		12.5	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	TRAV1-1	A0A0B4J248	108 aa		12.5	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	SPINK4	O60575	86 aa		12.5	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	PFN1	P07737	140 aa	Known RBP	12.5	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	TDRG1	Q3Y452	100 aa		12.5	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	ALKAL2	Q6UX46	152 aa		12.5	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	MANBAL	Q9NQG1	85 aa		12.5	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	SCO2	A0A1W2PP80	73 aa		12.49	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	NUDT3	O95989	172 aa		12.49	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	TYMS	P04818	313 aa		12.49	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	LGALS9B	Q3B8N2	356 aa		12.49	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	ZFP30	Q9Y2G7	519 aa		12.49	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		12.49	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-16	A0A0C4DH30	117 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	FABP5P3	A8MUU1	101 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	IGHV3-53	P01767	116 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902		P0DMU3	169 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	FAM231A	P0DMU4	169 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	FAM231C	P0DMU5	169 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	UBE2DNL	Q8IWF7	75 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	C15orf53	Q8NAA6	179 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	SPX	Q9BT56	116 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	C11orf21	Q9P2W6	132 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	KMT2A	Q03164	3969 aa		12.48	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	TRAV26-1	A0A087WT03	109 aa		12.47	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902		A0A0J9YY99	117 aa		12.47	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	IFNA1	P01562	189 aa		12.47	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	HOXA5	P20719	270 aa		12.47	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	ZC2HC1A	Q96GY0	325 aa		12.47	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	ORM1	P02763	201 aa		12.46	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	S100A9	P06702	114 aa	Known RBP	12.46	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	NHLRC2	Q8NBF2	726 aa		12.46	□□□□□ -0.41
USP19-210	ENST00000465902	TRBV6-1	A0A0K0K1D8	114 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902		M0R2P5	195 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	LTA	P01374	205 aa		12.45	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	S100A4	P26447	101 aa	Known RBP	12.44	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	FAM162B	Q5T6X4	162 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	C18orf15	Q96N68	181 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	VPS13D	Q5THJ4	4388 aa		12.44	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902		B4DEV8	164 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902		C9JCJ5	164 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902		M0R036	132 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	SH2D1A	O60880	128 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	CRIP1	P50238	77 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	BLOC1S1	P78537	153 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	BAGE2	Q86Y30	109 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	POM121L12	Q8N7R1	296 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	RASL10A	Q92737	203 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	TXNDC17	Q9BRA2	123 aa		12.43	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	IGKV3D-20	A0A0C4DH25	116 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	TRGV4	A0A0C4DH28	118 aa		12.42	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	RPL35	P42766	123 aa	Known RBP	12.42	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	MEF2B	Q02080	365 aa	Predicted RBP	12.42	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	SFTA3	P0C7M3	94 aa		12.41	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	BCL2	P10415	239 aa		12.41	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	ASIP	P42127	132 aa		12.41	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	ZNF876P	Q49A33	203 aa		12.41	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	COX8C	Q7Z4L0	72 aa		12.41	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	OR4C5	Q8NGB2	326 aa		12.41	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	VAX2	Q9UIW0	290 aa		12.41	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	TMSB15B	A0A087X1C1	80 aa		12.4	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	PAX4	O43316	350 aa		12.4	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	PDE6D	O43924	150 aa		12.4	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	ZNF674	Q2M3X9	581 aa		12.4	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	C11orf52	Q96A22	123 aa		12.4	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	ZNF479	Q96JC4	524 aa		12.4	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	DERL1	Q9BUN8	251 aa		12.4	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	MED9	Q9NWA0	146 aa		12.4	□□□□□ -0.42
USP19-210	ENST00000465902	GRIFIN	A4D1Z8	144 aa		12.39	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	KRBOX1	C9JBD0	128 aa		12.39	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	RNASE3	P12724	160 aa	Known RBP	12.39	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	PRR27	Q6MZM9	219 aa		12.39	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	HHLA3	Q9XRX5	114 aa		12.39	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	TRAV4	A0A0B4J268	109 aa		12.38	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	12.38	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	CCL18	P55774	89 aa		12.38	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	SLA	Q13239	276 aa		12.38	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	FHL2	Q14192	279 aa		12.38	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	RNF212	Q495C1	297 aa		12.38	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	VSIG2	Q96IQ7	327 aa		12.38	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	C9orf85	Q96MD7	179 aa		12.38	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	PRO0255	Q9UI72	69 aa		12.38	□□□□□ -0.43
USP19-210	ENST00000465902	RAB19	A4D1S5	217 aa		12.37	□□□□□ -0.43

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