RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368213.9

PTPRK-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 5,816 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-205ENST00000368213 IGHV3-30-5P0DP03 117 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-205ENST00000368213 IGLL1P15814 213 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF114Q8NC26 417 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRK-205ENST00000368213 K7EMT4 169 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-205ENST00000368213 SPRY2O43597 315 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-205ENST00000368213 CTSGP08311 255 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-205ENST00000368213 C22orf34Q6ZV56 151 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-205ENST00000368213 DEFB125Q8N687 156 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-205ENST00000368213 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
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PTPRK-205ENST00000368213 C16orf54Q6UWD8 224 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-205ENST00000368213 RNF183Q96D59 192 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-205ENST00000368213 ZNF625Q96I27 306 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
PTPRK-205ENST00000368213 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRK-205ENST00000368213 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRK-205ENST00000368213 C11orf45Q8TAV5 145 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRK-205ENST00000368213 FXYD5Q96DB9 178 aa8.34□□□□□ -1.07
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PTPRK-205ENST00000368213 SIGLEC8Q9NYZ4 499 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-205ENST00000368213 NCKAP5O14513 1909 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-205ENST00000368213 OBSL1O75147 1896 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRK-205ENST00000368213 C11orf71Q6IPW1 123 aa8.34□□□□□ -1.08
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PTPRK-205ENST00000368213 Q6ZSV7 163 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 NEGR1Q7Z3B1 354 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 TMEM126AQ9H061 195 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
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PTPRK-205ENST00000368213 C2orf66Q6UXQ4 117 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 HILS1P60008 231 aa8.33□□□□□ -1.08
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PTPRK-205ENST00000368213 CHAC1Q9BUX1 264 aa8.32□□□□□ -1.08
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PTPRK-205ENST00000368213 UBE2CO00762 179 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 CT83Q5H943 113 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 KIRREL3-AS3Q8N7Y1 241 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 CEP350Q5VT06 3117 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 K7EQD1 137 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 IGHG4P01861 327 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 TRBV12-3P01733 135 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 C15orf53Q8NAA6 179 aa8.31□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 SMR3AQ99954 134 aa8.31□□□□□ -1.08
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PTPRK-205ENST00000368213 TEX22C9J3V5 150 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 Q8N8P6 123 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 HHLA3Q9XRX5 114 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 CYYR1Q96J86 154 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRK-205ENST00000368213 CEP192Q8TEP8 1941 aa8.3□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 IGKV1-17P01599 117 aa8.3□□□□□ -1.08
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PTPRK-205ENST00000368213 A0A1B0GWB2 263 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 KRTAP10-9P60411 292 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 Q6ZWC4 215 aa8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 WIPF3A6NGB9 483 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 DDTP30046 118 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 ATXN8Q156A1 80 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 KLF12Q9Y4X4 402 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 ATRXP46100 2492 aa8.28□□□□□ -1.08
PTPRK-205ENST00000368213 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa8.28□□□□□ -1.08
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