RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000353258.7

GDE1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDE1, Length 2,958 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDE1-201ENST00000353258 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 B9A039 149 aa12.98□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 HLA-DMBP28068 263 aa12.98□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 ZFAND6Q6FIF0 208 aa12.98□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 IGFBPL1Q8WX77 278 aa12.98□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 TMEM78Q5T7P6 136 aa12.97□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 H7C1H1 209 aa12.97□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 A6NJY4 79 aa12.96□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 AKAP6Q13023 2319 aa12.96□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 CCL21O00585 134 aa12.96□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 UBE2D1P51668 147 aa12.96□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 UBE2D3P61077 147 aa12.96□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 UBE2D2P62837 147 aa12.96□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 TEX29Q8N6K0 151 aa12.96□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 NRACQ8N912 160 aa12.96□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 RAXQ9Y2V3 346 aa12.96□□□□□ -0.33
GDE1-201ENST00000353258 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP12.96□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 KLK15Q9H2R5 256 aa12.96□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 NCOR2Q9Y618 2525 aa12.95□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 FABP5P3A8MUU1 101 aa12.95□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 CNIH1O95406 144 aa12.95□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 TGFAP01135 160 aa12.95□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 ZNF688P0C7X2 276 aa12.95□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 SCGB1D4Q6XE38 83 aa12.95□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 SRSF8Q9BRL6 282 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 CHD8Q9HCK8 2581 aa12.95□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 SVEP1Q4LDE5 3571 aa12.94□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 IGHV1-3A0A0C4DH29 117 aa12.94□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 ZNF815PA8K554 130 aa12.94□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 H3BVH4 76 aa12.94□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 TCL1BO95988 128 aa12.94□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 SRSF9Q13242 221 aaKnown RBP eCLIP12.94□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 PLEKHB2Q96CS7 222 aa12.94□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 PRADC1Q9BSG0 188 aa12.94□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP12.94□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 IGHG4P01861 327 aa12.93□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 NHLRC4P0CG21 123 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 ERCC8Q13216 396 aa12.93□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 ZNF672Q499Z4 452 aaPredicted RBP12.93□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 ANKRD29Q8N6D5 301 aa12.93□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 VCX2Q9H322 139 aa12.93□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 ONECUT1Q9UBC0 465 aa12.93□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 TRAV12-1A0A0B4J245 112 aa12.93□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 A8MWV9 139 aa12.93□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 IGLV1-47P01700 117 aa12.93□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 CFHR4Q92496 578 aa12.93□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 BUB1B-PAK6H3BSN5 160 aa12.92□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa12.92□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 LYRM7Q5U5X0 104 aa12.92□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 RPL7P18124 248 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 DYNAPQ8N1N2 210 aa12.92□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 CITED1Q99966 193 aa12.92□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 CD7P09564 240 aa12.91□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 SHISA2Q6UWI4 295 aa12.91□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 IL17RELQ6ZVW7 336 aa12.91□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 SCGB3A1Q96QR1 104 aa12.91□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa12.9□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 RAB1BQ9H0U4 201 aa12.9□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 SLC25A16P16260 332 aa12.9□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 C11orf21Q9P2W6 132 aa12.9□□□□□ -0.34
GDE1-201ENST00000353258 PRAC2D3DTV9 90 aa12.9□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 NDUFA11Q86Y39 141 aa12.9□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 SBSPONQ8IVN8 264 aa12.9□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 NEXN-AS1Q8NBZ9 246 aa12.9□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa12.9□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 TMEM262E9PQX1 116 aa12.89□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 OR11H6Q8NGC7 330 aa12.89□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 TRBV7-9A0A0J9YWB2 115 aa12.89□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 KLHL30-AS1Q8NEE0 82 aa12.89□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 MSRB2Q9Y3D2 182 aa12.89□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa12.89□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 IGHV3OR16-8A0A075B7F1 116 aa12.88□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 SRD5A1P18405 259 aa12.88□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 ADORA2A-AS1P86434 159 aa12.88□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 AJUBAQ96IF1 538 aa12.88□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 SMIM2Q9BVW6 85 aa12.88□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa12.88□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 IGHV3-23P01764 117 aa12.88□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 PRTN3P24158 256 aa12.87□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 RASL10AQ92737 203 aa12.87□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 CACNA1BQ00975 2339 aa12.87□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 RHODO00212 210 aa12.87□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 TIMM23O14925 209 aa12.87□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 COX6B1P14854 86 aa12.87□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 F8W735 103 aaPredicted RBP12.87□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 HERV-K104P63124 156 aa12.87□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 CCDC179H3BU77 68 aa12.86□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 MFAP4P55083 255 aa12.86□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 GAGE2BQ13066 116 aa12.86□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 GAGE2EQ4V326 116 aa12.86□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 GAGE2DQ9UEU5 116 aa12.86□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 IGHV7-4-1A0A0J9YVY3 117 aa12.86□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 SCGB1C2P0DMR2 95 aa12.86□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 BAALCQ8WXS3 180 aa12.86□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 TOMM6Q96B49 74 aa12.86□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 TRAV4A0A0B4J268 109 aa12.85□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 SPANXN1Q5VSR9 72 aa12.85□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 SMIM20Q8N5G0 67 aa12.85□□□□□ -0.35
GDE1-201ENST00000353258 RNF182Q8N6D2 247 aa12.85□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84.4 ms