RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000348564.10

PTPRC-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRC, Length 4,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV2-33A0A075B6J2 118 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 S100A9P06702 114 aaKnown RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP10-3P60369 221 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 BEAN1Q3B7T3 259 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 FAM162BQ5T6X4 162 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 CEMP1Q6PRD7 247 aaPredicted RBP3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 SPXQ9BT56 116 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 RPS10P5Q9NQ39 176 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 EPDR1Q9UM22 224 aa3.32□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 HLA-DRB4P13762 266 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 FHITP49789 147 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL54Q6P161 138 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 CFAP161Q6P656 301 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 FA2HQ7L5A8 372 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 COMMD7Q86VX2 200 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 MGST2Q99735 147 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 BTF3P20290 206 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 CKS2P33552 79 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 AMTP48728 403 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 GAGE6Q13070 117 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 RHOHQ15669 191 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 ODF3L2Q3SX64 289 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 C17orf77Q96MU5 243 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 MANBALQ9NQG1 85 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 PRO0255Q9UI72 69 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 FBN2P35556 2912 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV20OR9-2A0A075B6H5 130 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV3-38A0A0C4DH36 116 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 A8MWP6 167 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 CRXO43186 299 aaPredicted RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 EDN2P20800 178 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 CLLU1Q5K131 121 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 ASPHD1Q5U4P2 390 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 LY96Q9Y6Y9 160 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 RHODO00212 210 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 ARMS2P0C7Q2 107 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 KRTAP10-11P60412 298 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 FABP9Q0Z7S8 132 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 ANXA2RQ3ZCQ2 193 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 ATP6V0E2Q8NHE4 81 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM170AQ8WVE7 144 aa3.31□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 A0A0J9YX75 114 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 NMBP08949 121 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM241Q24JQ0 296 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 C14orf178Q8N769 122 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 OR10G8Q8NGN5 311 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 PSMG3Q9BT73 122 aaPredicted RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 AGPAT4-IT1Q9H0P7 198 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 MRPL36Q9P0J6 103 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV9A0A0B4J1U6 114 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 A0A1W2PPQ1 181 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 LYRM9A8MSI8 78 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 H3BRN7 92 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 SIVA1O15304 175 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 VSIRQ9H7M9 311 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 KLK12Q9UKR0 248 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 LRCOL1A6NCL2 159 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 A8MWV9 139 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 AKR1D1P51857 326 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 PDE6HQ13956 83 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 MRGPRG-AS1Q2M3A8 158 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 SH2D6Q7Z4S9 175 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 C10orf126Q8N4M7 172 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 C11orf68Q9H3H3 251 aaKnown RBP3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 VAX2Q9UIW0 290 aa3.3□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 TRBV19A0A075B6N1 114 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 INS-IGF2F8WCM5 200 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 PDE6DO43924 150 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 CRYGDP07320 174 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 CR1P17927 2039 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 M0R2P5 195 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 GNRH2O43555 120 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 PRSS1P07477 247 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 NTF3P20783 257 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 Q6ZTI0 123 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 BAGE3Q86Y29 109 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 LINC00518Q8N0U6 118 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 TMEM263Q8WUH6 116 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 SAMD10Q9BYL1 202 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 ZFP30Q9Y2G7 519 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 IGLV10-54A0A075B6I4 117 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 C16orf90A8MZG2 172 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 LECT2O14960 151 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 TCRAP04437 139 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 S100A2P29034 98 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 GFI1BQ5VTD9 330 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 AMTNQ6UX39 209 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 ZNF114Q8NC26 417 aa3.29□□□□□ -1.88
PTPRC-201ENST00000348564 OR5A1Q8NGJ0 315 aa3.29□□□□□ -1.88
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