RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 TNCP24821 2201 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.81□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 Q6ZVH6 145 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 J3QLI3 93 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 K7EMT4 169 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 TRPT1Q86TN4 253 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 PCP2Q8IVA1 136 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 PLEKHB2Q96CS7 222 aa6.81□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 TRAV26-2A0A0B4J265 109 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 F8W1H4 67 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 SNCGO76070 127 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 LINC01356Q8N9X3 169 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 RNF185Q96GF1 192 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 TMEM89A2RUT3 159 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 OVOL3O00110 214 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 SCGB1A1P11684 91 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 PMVKQ15126 192 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 TOMM6Q96B49 74 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 ZGRF1Q86YA3 2104 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 COX6CP09669 75 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 LMO4P61968 165 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 IGKV3D-20A0A0C4DH25 116 aa6.8□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 PTPRBP23467 1997 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 MTURNQ8N3F0 131 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 CNOT1A5YKK6 2376 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 IGHV4-4A0A075B6R2 117 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 TRBV25-1A0A075B6N4 114 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 TRAV12-3A0A0B4J271 114 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 IGHG2P01859 326 aa6.79□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 GATA1P15976 413 aaPredicted RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 SPTAN1Q13813 2472 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 IGF1P05019 195 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 APOMO95445 188 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 DLX4Q92988 240 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 DUX3Q96PT4 197 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 TP53TG1Q9Y2A0 90 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 TRAV16A0A0A6YYK6 109 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 IGKV3-20P01619 116 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 IGHV4-39P01824 125 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 RHOHQ15669 191 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 SIGMAR1Q99720 223 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 TMEM238C9JI98 176 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 CIRBPQ14011 172 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 RNASE8Q8TDE3 154 aaKnown RBP6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 C10orf105Q8TEF2 133 aa6.78□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 CACNA1HO95180 2353 aa6.77□□□□□ -1.32
HERC3-201ENST00000264345 IGHV1OR15-1A0A075B7D0 117 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 C2orf91Q6ZV80 131 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 YAE1D1Q9NRH1 226 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 TRAV8-2A0A0B4J237 113 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 A6NDX4 124 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 F8W735 103 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 C12orf74Q32Q52 190 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 GTSF1LQ9H1H1 148 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 U3KQE9 123 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 PKDREJQ9NTG1 2253 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 PRSS47A8MTI9 375 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 ELANEP08246 267 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 SRD5A1P18405 259 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 CRIP2P52943 208 aaPredicted RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 ODF3Q96PU9 254 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 PRADC1Q9BSG0 188 aa6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 GEMIN7Q9H840 131 aaKnown RBP6.77□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 LINC01546A6NGU7 62 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 ZNF688P0C7X2 276 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 PIP4P2Q8N4L2 257 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 NBASA2RRP1 2371 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 I3L3M4 83 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 TSPAN13O95857 204 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 ZNF415Q09FC8 603 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 GPHB5Q86YW7 130 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 JMJD8Q96S16 334 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 SDHAF1A6NFY7 115 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 PRSS29PA6NIE9 313 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 BRI3O95415 125 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 OTOGLQ3ZCN5 2332 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 PGPEP1Q9NXJ5 209 aa6.76□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 IGLL5B9A064 214 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 CMC4P56277 68 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 CLPSL1A2RUU4 121 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 CD28P10747 220 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 RRN3P1Q2M238 152 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 FOXI2Q6ZQN5 318 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 A0A087WWL8 130 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 E9PLD3 99 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 GNRH2O43555 120 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 RPL32P62910 135 aaKnown RBP6.75□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 TM2D2Q9BX73 214 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.75□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 RNASE1P07998 156 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 KLK9Q2XQG4 91 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 LINC01587Q99440 93 aa6.74□□□□□ -1.33
HERC3-201ENST00000264345 TIMM17AQ99595 171 aa6.74□□□□□ -1.33
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