RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000246533.7

CAPNS1-201, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,918 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC01559Q495D7 138 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 NCR2O95944 276 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 MFAP4P55083 255 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 KRTAP10-3P60369 221 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 AP1S3Q96PC3 154 aa20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 TIMM8BQ9Y5J9 83 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
CAPNS1-201ENST00000246533 GAGE12BA1L429 117 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 GNG7O60262 68 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 NDUFA3O95167 84 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 OR8A1Q8NGG7 326 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 TPPP3Q9BW30 176 aa20.2■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 NPIPB5A8MRT5 1133 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SH2D1AO60880 128 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 RPL7P18124 248 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF151Q2KHN1 245 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 C16orf95Q9H693 158 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 CLPSL1A2RUU4 121 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 C5orf56Q8N8D9 126 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MOB4Q9Y3A3 225 aa20.19■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 TRAV8-6A0A0B4J262 113 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 C9orf118A6NHY6 69 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 C8orf49Q96NF6 230 aa20.18■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 GAGE10A6NGK3 116 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 MRPL51Q4U2R6 128 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8N9W7 124 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC01546A6NGU7 62 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC01548A6NM66 108 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 PROK1P58294 105 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 IFI27L1Q96BM0 104 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 VPS25Q9BRG1 176 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 RABAC1Q9UI14 185 aa20.17■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 M0R3E3 92 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 AMN1Q8IY45 258 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 SPATA3Q8NHX4 192 aa20.16■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 Q8N2B8 174 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 PRR25Q96S07 402 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 THYN1Q9P016 225 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLV11-55A0A075B6I3 123 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 ERASQ7Z444 233 aa20.15■□□□□ 0.82
CAPNS1-201ENST00000246533 LOC389332A0A1B0GUA5 103 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 TMEM213A2RRL7 107 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 CKS2P33552 79 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 UFSP1Q6NVU6 142 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 C3orf56Q8N813 242 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 FER1L6-AS1Q8NA97 138 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 VWFP04275 2813 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 CACNG7P62955 275 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 FAM106AQ4KMX7 169 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 WFDC12Q8WWY7 111 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 LINC00527Q9UJ94 153 aa20.14■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 IGLC6P0CF74 106 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 CNFNQ9BYD5 112 aa20.13■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 TTC9CQ8N5M4 171 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 C10orf99Q6UWK7 81 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 C11orf44Q8N8P7 122 aa20.12■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 C5orf64Q2M2E5 130 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 ZNF562Q6V9R5 426 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 FANCD2OSQ96PS1 177 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 MAP1LC3AQ9H492 121 aa20.11■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 TWIST1Q15672 202 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 C21orf62Q9NYP8 219 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 NXT2Q9NPJ8 142 aaKnown RBP20.1■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 WNK1Q9H4A3 2382 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 K7EP34 96 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 OR5A1Q8NGJ0 315 aa20.09■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 EGR2P11161 476 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 HIGD1BQ9P298 99 aa20.08■□□□□ 0.81
CAPNS1-201ENST00000246533 TMSB15BA0A087X1C1 80 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 SNAI2O43623 268 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 RAB9AP51151 201 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ASCL2Q99929 193 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 SMPXQ9UHP9 88 aa20.08■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 NPYP01303 97 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 KIR3DS1Q14943 382 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ARPC1AQ92747 370 aa20.07■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 A0A0G2JLM5 398 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHG2P01859 326 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV2-40A0A087WW87 121 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 FABP5P3A8MUU1 101 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 F8W735 103 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 IGKV2D-40P01614 121 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 FCER1GP30273 86 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 ZMAT4Q9H898 229 aa20.06■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CMYA5Q8N3K9 4069 aa20.05■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 RBAKDNA6NC62 111 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-DRB4P13762 266 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 NDPQ00604 133 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 OR2K2Q8NGT1 345 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 HLA-DRB4X5D2U9 266 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CITED1Q99966 193 aa20.04■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 FOXE3Q13461 319 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 CSTL1Q9H114 145 aa20.03■□□□□ 0.8
CAPNS1-201ENST00000246533 H3BUT2 72 aa20.02■□□□□ 0.79
CAPNS1-201ENST00000246533 CD28P10747 220 aa20.02■□□□□ 0.79
CAPNS1-201ENST00000246533 RNF185Q96GF1 192 aa20.02■□□□□ 0.79
CAPNS1-201ENST00000246533 ATP5LO75964 103 aa20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 104.7 ms