RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 RPL32P62910 135 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
PRRX1-201ENST00000239461 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.31□□□□□ -1.08
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PRRX1-201ENST00000239461 DGAT2L7PQ6IED9 249 aa8.31□□□□□ -1.08
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PRRX1-201ENST00000239461 OR10J6PQ8NGY7 276 aa8.31□□□□□ -1.08
PRRX1-201ENST00000239461 DUX3Q96PT4 197 aa8.31□□□□□ -1.08
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PRRX1-201ENST00000239461 C5orf56Q8N8D9 126 aa8.31□□□□□ -1.08
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PRRX1-201ENST00000239461 ZC2HC1AQ96GY0 325 aa8.27□□□□□ -1.09
PRRX1-201ENST00000239461 C1QTNF4Q9BXJ3 329 aa8.27□□□□□ -1.09
PRRX1-201ENST00000239461 SYNJ2BPP57105 145 aa8.26□□□□□ -1.09
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PRRX1-201ENST00000239461 OVOL1O14753 267 aa8.24□□□□□ -1.09
PRRX1-201ENST00000239461 IGHG2P01859 326 aa8.24□□□□□ -1.09
PRRX1-201ENST00000239461 A6NDX4 124 aa8.24□□□□□ -1.09
PRRX1-201ENST00000239461 TCTEX1D4Q5JR98 221 aa8.24□□□□□ -1.09
PRRX1-201ENST00000239461 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
PRRX1-201ENST00000239461 SPANXN1Q5VSR9 72 aa8.24□□□□□ -1.09
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