RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000208091.1

Smarca2-231, Transcript of Probable global transcription activator SNF2L2, mouse

TSL 5 BASIC

Gene Smarca2, Length 1,140 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rims4	P60191	269 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Vamp3	P63024	103 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Vmn1r15	Q14C10	299 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Gm21943	Q5FWD5	227 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rasef	Q5RI75	627 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Mef2a	Q60929	498 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Olfr1356	Q7TQU8	320 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Olfr823	Q7TRH2	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Harbi1	Q8BR93	349 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ankrd46	Q8BTZ5	228 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Pgam5	Q8BX10	288 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Poc1a	Q8JZX3	405 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	B3gnt8	Q8R3I9	389 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Bles03	Q8VD62	251 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Olfr824	Q8VFU4	315 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Olfr1217	Q8VGG1	304 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Mrps24	Q9CQV5	167 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rpl22l1	Q9D7S7	122 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Tmem68	Q9D850	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Eppin	Q9DA01	134 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Tomm40	Q9QYA2	361 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Nupr1	Q9WTK0	80 aa		4.6	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	BC053393	A0A0B4J1F6	192 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Olfr588-ps1	A0A1B0GSZ2	313 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Mettl23	A2AA28	253 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Vmn1r9	A2RST7	299 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Gm21974	F6W3F3	119 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Hsd17b10	O08756	261 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Gamt	O35969	236 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ca11	O70354	328 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091		P01882	290 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Hbb-y	P02104	147 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ifna7	P06799	190 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ang	P21570	145 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rcvrn	P34057	202 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rps11	P62281	158 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rpl30	P62889	115 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Xlr3a	Q60595	226 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Gngt1	Q61012	74 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Srm	Q64674	302 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Adat3	Q6PAT0	349 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091		Q80Y39	304 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Sec22a	Q8BH47	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Mob3a	Q8BSU7	217 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Nhlrc3	Q8CCH2	347 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Lrrc20	Q8CI70	184 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Esco2	Q8CIB9	592 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Tlcd2	Q8VC26	310 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Olfr1170	Q8VFG1	316 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Cacng5	Q8VHW4	275 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Paip2b	Q91W45	136 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Fam103a1	Q9CQY2	119 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Slc25a22	Q9D6M3	323 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ica	Q9DBD0	700 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Olfr944	Q9EQ91	311 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Gpr35	Q9ES90	307 aa		4.59	□□□□□ -1.67
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Trbv2	A0A0B4J1G8	114 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Trbv19	A0A0B4J1H4	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ighv8-12	A0A0G2JDE1	119 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Igkv14-130	A0A0G2JF45	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rhox3g	B9EJQ9	160 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	1810032O08Rik	E9PZV8	113 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Olfr1218	L7MU54	311 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Lfng	O09010	378 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091		P01729	129 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091		P04212	136 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Hoxa1	P09022	331 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Ifna9	P09235	190 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Kras	P32883	189 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Etv1	P41164	477 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Nkx2-1	P50220	372 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Tmem14a	P56983	99 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Rpl8	P62918	257 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Arglu1	Q3UL36	271 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Olfr1113	Q7TR54	326 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Eif4ebp3	Q80VV3	101 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Cebpzos	Q8BTE5	80 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Vmn1r32	Q8R2D9	302 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Gabarapl1	Q8R3R8	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Olfr491	Q8VG06	310 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Olfr1242	Q8VGM6	306 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	D6Wsu163e	Q91YN0	552 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Dram2	Q9CR48	267 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	4930470P17Rik	Q9D542	155 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Trir	Q9D735	173 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Tmprss2	Q9JIQ8	490 aa		4.58	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Iglv1	A0A075B663	117 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Gm29735	A0A1B0GT06	219 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Akirin2	B1AXD8	201 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Tmem233	D3Z1U7	110 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	E430018J23Rik	E9PZQ8	461 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Gm8220	F6YKI2	213 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Spin2e	J3QNQ0	234 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Nipsnap1	O55125	284 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Krt1	P04104	637 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Defa2	P28309	93 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Cox7a2	P48771	83 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Gcg	P55095	180 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Dynlt3	P56387	116 aa		4.57	□□□□□ -1.68
Smarca2-231	ENSMUST00000208091	Gabra1	P62812	455 aa		4.57	□□□□□ -1.68

Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 44.7 ms