Protein–RNA interactions for Protein: O35969

Gamt, Guanidinoacetate N-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GamtO35969 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC29,51■■■□□ 2,31
GamtO35969 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,41■■■□□ 2,3
GamtO35969 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,38■■■□□ 2,13
GamtO35969 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,34■■■□□ 2,13
GamtO35969 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC27,49■■□□□ 1,99
GamtO35969 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
GamtO35969 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
GamtO35969 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
GamtO35969 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
GamtO35969 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,73■■□□□ 1,87
GamtO35969 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,66■■□□□ 1,86
GamtO35969 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC26,5■■□□□ 1,83
GamtO35969 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
GamtO35969 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
GamtO35969 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
GamtO35969 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
GamtO35969 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC26,22■■□□□ 1,79
GamtO35969 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26,03■■□□□ 1,76
GamtO35969 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
GamtO35969 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
GamtO35969 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
GamtO35969 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
GamtO35969 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
GamtO35969 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
GamtO35969 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
GamtO35969 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
GamtO35969 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
GamtO35969 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
GamtO35969 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
GamtO35969 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25,4■■□□□ 1,66
GamtO35969 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC25,38■■□□□ 1,65
GamtO35969 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
GamtO35969 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC25,27■■□□□ 1,64
GamtO35969 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
GamtO35969 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,23■■□□□ 1,63
GamtO35969 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,16■■□□□ 1,62
GamtO35969 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC25,12■■□□□ 1,61
GamtO35969 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
GamtO35969 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
GamtO35969 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24,91■■□□□ 1,58
GamtO35969 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,89■■□□□ 1,57
GamtO35969 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
GamtO35969 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
GamtO35969 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC24,79■■□□□ 1,56
GamtO35969 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24,77■■□□□ 1,56
GamtO35969 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,74■■□□□ 1,55
GamtO35969 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
GamtO35969 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,62■■□□□ 1,53
GamtO35969 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
GamtO35969 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
GamtO35969 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
GamtO35969 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,49■■□□□ 1,51
GamtO35969 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24,44■■□□□ 1,5
GamtO35969 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
GamtO35969 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,39■■□□□ 1,49
GamtO35969 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,49
GamtO35969 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
GamtO35969 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
GamtO35969 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
GamtO35969 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,29■■□□□ 1,48
GamtO35969 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,27■■□□□ 1,48
GamtO35969 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
GamtO35969 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,25■■□□□ 1,47
GamtO35969 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24,25■■□□□ 1,47
GamtO35969 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,19■■□□□ 1,46
GamtO35969 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,16■■□□□ 1,46
GamtO35969 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
GamtO35969 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,06■■□□□ 1,44
GamtO35969 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24,01■■□□□ 1,43
GamtO35969 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,98■■□□□ 1,43
GamtO35969 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,96■■□□□ 1,43
GamtO35969 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,95■■□□□ 1,42
GamtO35969 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
GamtO35969 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
GamtO35969 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23,89■■□□□ 1,42
GamtO35969 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,84■■□□□ 1,41
GamtO35969 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,41
GamtO35969 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,83■■□□□ 1,4
GamtO35969 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,8■■□□□ 1,4
GamtO35969 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23,69■■□□□ 1,38
GamtO35969 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
GamtO35969 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
GamtO35969 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,61■■□□□ 1,37
GamtO35969 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
GamtO35969 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,56■■□□□ 1,36
GamtO35969 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
GamtO35969 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,53■■□□□ 1,36
GamtO35969 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
GamtO35969 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
GamtO35969 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,48■■□□□ 1,35
GamtO35969 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
GamtO35969 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
GamtO35969 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
GamtO35969 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
GamtO35969 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
GamtO35969 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
GamtO35969 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC23,38■■□□□ 1,33
GamtO35969 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
GamtO35969 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,34■■□□□ 1,33
GamtO35969 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,7 ms